Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	292378	292408	31	37 [0]	[0] 77	yagK/yagL	conserved hypothetical protein/DNA‑binding protein

CTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAAT  >  W3110S.gb/292315‑292377                                                               | cTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAAt  >  1:584151/1‑63 (MQ=255) cTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAAt  >  1:324538/1‑63 (MQ=255) cTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAAt  >  1:389867/1‑63 (MQ=255) cTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAAt  >  1:420595/1‑63 (MQ=255) cTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAAt  >  1:427850/1‑63 (MQ=255) cTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAAt  >  1:449566/1‑63 (MQ=255) cTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAAt  >  1:456925/1‑63 (MQ=255) cTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAAt  >  1:486998/1‑63 (MQ=255) cTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAAt  >  1:494581/1‑63 (MQ=255) cTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAAt  >  1:523802/1‑63 (MQ=255) cTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAAt  >  1:302616/1‑63 (MQ=255) cTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAAt  >  1:617617/1‑63 (MQ=255) cTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAAt  >  1:631785/1‑63 (MQ=255) cTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAAt  >  1:639579/1‑63 (MQ=255) cTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAAt  >  1:656617/1‑63 (MQ=255) cTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAAt  >  1:680131/1‑63 (MQ=255) cTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAAt  >  1:681664/1‑63 (MQ=255) cTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAAt  >  1:782206/1‑63 (MQ=255) cTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAAt  >  1:824499/1‑63 (MQ=255) cTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAAt  >  1:1515716/1‑63 (MQ=255) cTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAAt  >  1:1137429/1‑63 (MQ=255) cTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAAt  >  1:1148310/1‑63 (MQ=255) cTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAAt  >  1:1180954/1‑63 (MQ=255) cTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAAt  >  1:1192200/1‑63 (MQ=255) cTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAAt  >  1:1353334/1‑63 (MQ=255) cTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAAt  >  1:1468348/1‑63 (MQ=255) cTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAAt  >  1:1469355/1‑63 (MQ=255) cTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAAt  >  1:1513180/1‑63 (MQ=255) cTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAAt  >  1:1031971/1‑63 (MQ=255) cTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAAt  >  1:1547089/1‑63 (MQ=255) cTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAAt  >  1:1609730/1‑63 (MQ=255) cTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAAt  >  1:1668517/1‑63 (MQ=255) cTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAAt  >  1:1716551/1‑63 (MQ=255) cTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAAt  >  1:1769477/1‑63 (MQ=255) cTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAAt  >  1:1816646/1‑63 (MQ=255) cTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAAt  >  1:1818429/1‑63 (MQ=255) cTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAAt  >  1:1853859/1‑63 (MQ=255)                                                               | CTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAAT  >  W3110S.gb/292315‑292377

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑