Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 3289052 3289087 36 95 [0] [0] 36 yraJ predicted outer membrane protein

CGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGA  >  W3110S.gb/3288988‑3289051
                                                               |
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:344503/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:533110/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:515686/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:515384/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:515209/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:50073/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:445732/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:440217/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:432959/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:400640/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:396536/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:356147/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:565209/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:31215/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:296178/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:290111/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:278654/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:241578/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:232096/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:231869/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:225814/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:1004613/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:1883529/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:746001/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:961279/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:935793/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:892738/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:871319/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:856577/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:831505/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:825401/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:79487/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:777595/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:764989/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:194692/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:740120/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:715979/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:687329/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:68406/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:661898/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:657154/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:643985/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:6405/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:623670/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:613529/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:1184598/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:1313469/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:1310185/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:1858552/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:1297722/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:1276411/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:1245450/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:1241611/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:1225691/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:1224164/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:1223478/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:1198921/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:1303931/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:1154759/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:1149510/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:1133266/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:1122584/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:1120989/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:1104206/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:1102548/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:1098763/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:1078508/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:106148/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:1521296/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:1850885/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:1836637/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:181446/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:1788883/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:1701308/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:1674685/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:1652323/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:1573592/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:1318126/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:1494944/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:1469134/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:1459842/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:144188/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:1425503/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:1419781/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:1324200/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGGGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:443010/64‑1 (MQ=255)
cGGTAGAACAACAACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:1411279/64‑1 (MQ=255)
 ggTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:1536495/63‑1 (MQ=255)
 ggTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:1800597/63‑1 (MQ=255)
 ggTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:1063779/63‑1 (MQ=255)
 ggTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATCAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:769153/63‑1 (MQ=255)
    aGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:647651/60‑1 (MQ=255)
                  aGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:1502349/46‑1 (MQ=255)
                   gCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:659259/45‑1 (MQ=255)
                          aTTAAGGTGGATTAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGa  <  1:816003/38‑1 (MQ=255)
                                                               |
CGGTAGAACAACTACGTGAGCTGGGTATTAAGGTGGATGAAATCCCGGCGCTGGCTGAAAAAGA  >  W3110S.gb/3288988‑3289051

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: