Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	293384	293438	55	85 [0]	[0] 133	yagM	hypothetical protein

CATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACA  >  W3110S.gb/293319‑293383                                                                 | cATGACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:1034894/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAGTCAATTGGGATGTTGACa  <  1:902809/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:1816679/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:473831/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:464777/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:310670/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:306285/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:255138/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:248126/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:237422/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:212802/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:200075/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:522330/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:1815680/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:1777008/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:1758082/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:1737061/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:1735322/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:1726676/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:1713279/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:847669/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:979800/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:97859/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:96291/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:949397/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:939758/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:876530/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:875733/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:85623/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:502162/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:844774/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:812605/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:691865/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:605919/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:60025/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:545179/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:1017529/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:1217305/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:1256339/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:1268750/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:1250129/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:1287467/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:1296014/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:130526/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:1694784/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:1314872/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:1317045/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:1342419/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:1246597/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:1357786/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:1375258/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:1170024/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:10917/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:1004219/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:1589875/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:1564759/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:1020303/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:1076086/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:152144/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:150974/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:1484572/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:11267/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:1437908/65‑1 (MQ=255) cATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGCGATGTTGACa  <  1:828709/65‑1 (MQ=255)  aTAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:761337/64‑1 (MQ=255)                      aaGATCTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:131776/44‑1 (MQ=255)                      aaGAACTTCTTTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:91856/44‑1 (MQ=255)                      aaGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:1123894/44‑1 (MQ=255)                      aaGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:1135690/44‑1 (MQ=255)                      aaGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:527025/44‑1 (MQ=255)                      aaGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:803583/44‑1 (MQ=255)                      aaGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:769282/44‑1 (MQ=255)                      aaGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:660753/44‑1 (MQ=255)                      aaGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:654973/44‑1 (MQ=255)                      aaGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:439445/44‑1 (MQ=255)                      aaGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:1377615/44‑1 (MQ=255)                      aaGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:1417099/44‑1 (MQ=255)                      aaGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:1418251/44‑1 (MQ=255)                      aaGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:1471439/44‑1 (MQ=255)                      aaGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:1760024/44‑1 (MQ=255)                      aaGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:1741976/44‑1 (MQ=255)                      aaGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:1528233/44‑1 (MQ=255)                      aaGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:1669294/44‑1 (MQ=255)                         aaCTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:1500286/41‑1 (MQ=255)                             tCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACa  <  1:192467/37‑1 (MQ=255)                                                                 | CATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACA  >  W3110S.gb/293319‑293383

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑