Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3309523	3309633	111	60 [0]	[0] 91	pnp	polynucleotide phosphorylase/polyadenylase

CGCAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAC  >  W3110S.gb/3309458‑3309522                                                                 | cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:6154/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:1030715/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:1737320/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:1751685/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:1779896/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:1787799/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:236386/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:244810/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:286471/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:361826/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:437257/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:441724/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:458085/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:489300/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:597418/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:1715669/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:643108/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:661712/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:691756/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:729267/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:769534/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:777289/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:792981/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:794579/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:830999/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:855552/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:855978/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:87713/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:974846/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:98841/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:1435653/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:1062842/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:1071375/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:108609/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:1091861/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:1102520/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:1144801/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:1281663/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:1289602/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:1291092/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:1333403/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:1361271/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:1362328/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:1368792/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:142570/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:1692910/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:1451745/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:1482625/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:1538862/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:1559527/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:1580463/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:1583769/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:1595016/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:160371/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:1643683/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:1645265/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:1655710/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:1680171/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:1686223/1‑65 (MQ=255) cgcAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTAATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAc  >  1:400652/1‑65 (MQ=255)                                                                 | CGCAACCTGCATGATCTCTTTGGTGATACCTTCAATTTTGATATCCATCTGCAGTGCAGAGATAC  >  W3110S.gb/3309458‑3309522

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑