Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3380096	3380156	61	65 [0]	[0] 10	yhcB	conserved hypothetical protein

CAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTGG  >  W3110S.gb/3380031‑3380095                                                                 | cAACGGGAGATGTTTATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:161306/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:535759/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:1828286/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:1877421/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:1010829/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:1880917/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:221980/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:228091/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:25306/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:264563/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:280174/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:29911/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:418348/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:525596/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:531276/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:1877707/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:557125/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:579858/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:606954/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:6084/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:706663/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:744889/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:755075/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:81928/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:820320/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:894035/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:894096/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:907798/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:911576/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:1456208/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:1039023/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:1181588/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:1196863/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:1302849/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:135454/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:1401525/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:1403839/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:1432585/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:1458355/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:1463608/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:1513464/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:1534406/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:1803315/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:1534676/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:1543951/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:1802448/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:1560351/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:156751/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:1661661/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:15807/65‑1 (MQ=255) cAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGGTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:86568/65‑1 (MQ=255)  aaCGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:702076/64‑1 (MQ=255)  aaCGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:1880307/64‑1 (MQ=255)  aaCGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:729793/64‑1 (MQ=255)  aaCGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:1827324/64‑1 (MQ=255)  aaCGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGGTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:1559045/64‑1 (MQ=255)   aCGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:364908/63‑1 (MQ=255)   aCGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:1513922/63‑1 (MQ=255)    cGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:63611/62‑1 (MQ=255)     gggAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:1308450/61‑1 (MQ=255)         gaTGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:1123353/57‑1 (MQ=255)                   aCCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:61131/47‑1 (MQ=255)                            tatGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:64591/38‑1 (MQ=255)                            tatGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:1712867/38‑1 (MQ=255)                             atGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTgg  <  1:1152063/37‑1 (MQ=255)                                                                 | CAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCATCATTATTGG  >  W3110S.gb/3380031‑3380095

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑