Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3384592	3385090	499	66 [0]	[0] 11	[argR]	[argR]

AATGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGTTA  >  W3110S.gb/3384526‑3384591                                                                  | aatGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCT‑AGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:1722955/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCTGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:1479606/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:554107/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:56483/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:485170/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:457701/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:429401/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:421215/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:394174/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:366845/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:360981/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:328647/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:262182/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:250234/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:240751/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:20400/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:1002187/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:195945/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:633129/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:633618/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:637965/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:653645/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:678103/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:691026/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:736630/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:740474/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:746147/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:811870/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:882066/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:937428/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:949465/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:975708/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:1560965/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:1121145/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:1181130/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:1187499/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:1216341/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:1232376/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:1242217/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:1295697/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:1359443/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:1368521/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:1369736/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:137779/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:1402897/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:1499785/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:1549025/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:193653/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:1677287/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:1715153/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:1714948/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:1701126/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:1689096/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:1679485/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:1652477/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:1640433/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:1639206/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:1615558/65‑1 (MQ=255)  atGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:1568169/65‑1 (MQ=255)   tgttgtATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:441945/64‑1 (MQ=255)   tgttgtATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:15060/64‑1 (MQ=255)   tgttgtATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:1704395/64‑1 (MQ=255)     ttgtATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:1569058/62‑1 (MQ=255)      tgtgTCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:487844/61‑1 (MQ=255)           cAACCACCAAATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAACCAAGAAGAACTAGcta  <  1:823426/56‑1 (MQ=255)                       cGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGtta  <  1:204529/44‑1 (MQ=255)                                                                  | AATGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGTTA  >  W3110S.gb/3384526‑3384591

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑