Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3415649	3415709	61	62 [0]	[0] 9	acrF	multidrug efflux system protein

TCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTAAA  >  W3110S.gb/3415584‑3415648                                                                 | tCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCGAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:553222/65‑1 (MQ=255) tCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:622691/65‑1 (MQ=255) tCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:180299/65‑1 (MQ=255) tCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:251163/65‑1 (MQ=255) tCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:275721/65‑1 (MQ=255) tCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:1032508/65‑1 (MQ=255) tCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:294275/65‑1 (MQ=255) tCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:378627/65‑1 (MQ=255) tCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:46418/65‑1 (MQ=255) tCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:468393/65‑1 (MQ=255) tCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:490400/65‑1 (MQ=255) tCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:543852/65‑1 (MQ=255) tCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:603094/65‑1 (MQ=255) tCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:613288/65‑1 (MQ=255) tCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:289086/65‑1 (MQ=255) tCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:634759/65‑1 (MQ=255) tCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:654662/65‑1 (MQ=255) tCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:655730/65‑1 (MQ=255) tCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:660781/65‑1 (MQ=255) tCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:672715/65‑1 (MQ=255) tCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:730558/65‑1 (MQ=255) tCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:78512/65‑1 (MQ=255) tCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:877619/65‑1 (MQ=255) tCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:938305/65‑1 (MQ=255) tCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:957047/65‑1 (MQ=255) tCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:976851/65‑1 (MQ=255) tCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:985274/65‑1 (MQ=255) tCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:1422229/65‑1 (MQ=255) tCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:1041826/65‑1 (MQ=255) tCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:1088172/65‑1 (MQ=255) tCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:1096221/65‑1 (MQ=255) tCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:1114147/65‑1 (MQ=255) tCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:1184482/65‑1 (MQ=255) tCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:1241071/65‑1 (MQ=255) tCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:1254653/65‑1 (MQ=255) tCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:1359938/65‑1 (MQ=255) tCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:1416461/65‑1 (MQ=255) tCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:14204/65‑1 (MQ=255) tCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:1802253/65‑1 (MQ=255) tCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:1487988/65‑1 (MQ=255) tCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:150178/65‑1 (MQ=255) tCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:180146/65‑1 (MQ=255) tCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:1583075/65‑1 (MQ=255) tCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:17489/65‑1 (MQ=255) tCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:170254/65‑1 (MQ=255) tCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:1562700/65‑1 (MQ=255) tCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:1679697/65‑1 (MQ=255) tCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAAATCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:1339785/65‑1 (MQ=255)  cGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:38252/64‑1 (MQ=255)  cGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:250657/64‑1 (MQ=255)  cGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:972972/64‑1 (MQ=255)  cGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:1787722/64‑1 (MQ=255)  cGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:1104638/64‑1 (MQ=255)  cGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:744878/64‑1 (MQ=255)  cGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:1297340/64‑1 (MQ=255)  cGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:416557/64‑1 (MQ=255)  cGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:1650147/64‑1 (MQ=255)  cGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:633995/64‑1 (MQ=255)  cGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:163961/64‑1 (MQ=255)  cGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:531188/64‑1 (MQ=255)  cGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:577840/64‑1 (MQ=255)  cGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAAATCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTaaa  <  1:759218/64‑1 (MQ=255)                                                                 | TCGATTATTGCTCAGACGCGGTTTAAAAATCCGGAAGAATTCGGCAAAGTGACCCTGCGCGTAAA  >  W3110S.gb/3415584‑3415648

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑