Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3477380	3477395	16	82 [0]	[0] 51	oxyR	DNA‑binding transcriptional dual regulator

CTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATAA  >  W3110S.gb/3477317‑3477379                                                               | cTTGTGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:12388/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCCGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:1072238/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:5474/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:655886/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:546533/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:540379/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:523800/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:520791/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:457470/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:420388/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:386713/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:372755/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:36962/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:363789/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:360086/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:329200/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:310569/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:278173/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:267272/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:24560/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:215572/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:1876980/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:858567/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:994050/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:986883/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:967231/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:964302/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:928392/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:880114/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:874201/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:870425/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:868464/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:594792/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:854042/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:828816/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:817540/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:807230/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:797509/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:77224/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:738010/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:699831/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:1820503/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:1269678/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:1860853/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:1442570/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:1432439/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:1415097/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:1402299/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:1345057/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:1324884/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:1302293/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:1290037/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:1459841/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:1220439/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:119585/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:1138521/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:1127301/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:1108871/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:1047724/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:1043037/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:1033945/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:1018665/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:1653072/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:1006566/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:1808329/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:177214/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:1762650/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:1739095/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:1715656/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:1714808/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:1663102/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:1663049/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:1510420/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:1648862/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:1648034/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:1640498/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:1635287/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:1603221/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:1599535/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:1568209/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:1566568/1‑63 (MQ=255) cTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGCCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATaa  >  1:1282721/1‑63 (MQ=255)                                                               | CTTGCGCGGATGGCCTCTGCCAGCTGCTCATAGCGGCTGCGCAGCGGTGAGCCAGGACGATAA  >  W3110S.gb/3477317‑3477379

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑