Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3487832	3488042	211	45 [0]	[0] 48	yijP	conserved inner membrane protein

AACCCGAACGGTTTCCTGGTTTATTTCTCTGACCACGGTGAAGAGGTTTACGACACGCCGCCGCAC  >  W3110S.gb/3487766‑3487831                                                                  | aaCCCGAACGGTTTCCTGGTTTATTTCTCTGACCACGGTGAAGAGGTTTACGACACGCC‑CCGcac  <  1:599514/65‑1 (MQ=255)  aCCCGAACGGTTTCCTGGTTTATTTCTCTGACCAGGGTGAAGAGGTTTACGACTCGCCGCCGcac  <  1:1674026/65‑1 (MQ=255)  aCCCGAACGGTTTCCTGGTTTATTTCTCTGACCACGGTGAAGAGTTTTACGACACGCCGCCGcac  <  1:1860450/65‑1 (MQ=255)  aCCCGAACGGTTTCCTGGTTTATTTCTCTGACCACGGTGAAGAGGTTTACGACACGCCGCCGcac  <  1:603231/65‑1 (MQ=255)  aCCCGAACGGTTTCCTGGTTTATTTCTCTGACCACGGTGAAGAGGTTTACGACACGCCGCCGcac  <  1:309742/65‑1 (MQ=255)  aCCCGAACGGTTTCCTGGTTTATTTCTCTGACCACGGTGAAGAGGTTTACGACACGCCGCCGcac  <  1:316654/65‑1 (MQ=255)  aCCCGAACGGTTTCCTGGTTTATTTCTCTGACCACGGTGAAGAGGTTTACGACACGCCGCCGcac  <  1:325441/65‑1 (MQ=255)  aCCCGAACGGTTTCCTGGTTTATTTCTCTGACCACGGTGAAGAGGTTTACGACACGCCGCCGcac  <  1:327607/65‑1 (MQ=255)  aCCCGAACGGTTTCCTGGTTTATTTCTCTGACCACGGTGAAGAGGTTTACGACACGCCGCCGcac  <  1:331986/65‑1 (MQ=255)  aCCCGAACGGTTTCCTGGTTTATTTCTCTGACCACGGTGAAGAGGTTTACGACACGCCGCCGcac  <  1:546068/65‑1 (MQ=255)  aCCCGAACGGTTTCCTGGTTTATTTCTCTGACCACGGTGAAGAGGTTTACGACACGCCGCCGcac  <  1:54835/65‑1 (MQ=255)  aCCCGAACGGTTTCCTGGTTTATTTCTCTGACCACGGTGAAGAGGTTTACGACACGCCGCCGcac  <  1:574032/65‑1 (MQ=255)  aCCCGAACGGTTTCCTGGTTTATTTCTCTGACCACGGTGAAGAGGTTTACGACACGCCGCCGcac  <  1:988126/65‑1 (MQ=255)  aCCCGAACGGTTTCCTGGTTTATTTCTCTGACCACGGTGAAGAGGTTTACGACACGCCGCCGcac  <  1:604972/65‑1 (MQ=255)  aCCCGAACGGTTTCCTGGTTTATTTCTCTGACCACGGTGAAGAGGTTTACGACACGCCGCCGcac  <  1:625674/65‑1 (MQ=255)  aCCCGAACGGTTTCCTGGTTTATTTCTCTGACCACGGTGAAGAGGTTTACGACACGCCGCCGcac  <  1:737941/65‑1 (MQ=255)  aCCCGAACGGTTTCCTGGTTTATTTCTCTGACCACGGTGAAGAGGTTTACGACACGCCGCCGcac  <  1:786578/65‑1 (MQ=255)  aCCCGAACGGTTTCCTGGTTTATTTCTCTGACCACGGTGAAGAGGTTTACGACACGCCGCCGcac  <  1:797655/65‑1 (MQ=255)  aCCCGAACGGTTTCCTGGTTTATTTCTCTGACCACGGTGAAGAGGTTTACGACACGCCGCCGcac  <  1:843476/65‑1 (MQ=255)  aCCCGAACGGTTTCCTGGTTTATTTCTCTGACCACGGTGAAGAGGTTTACGACACGCCGCCGcac  <  1:863993/65‑1 (MQ=255)  aCCCGAACGGTTTCCTGGTTTATTTCTCTGACCACGGTGAAGAGGTTTACGACACGCCGCCGcac  <  1:920575/65‑1 (MQ=255)  aCCCGAACGGTTTCCTGGTTTATTTCTCTGACCACGGTGAAGAGGTTTACGACACGCCGCCGcac  <  1:966572/65‑1 (MQ=255)  aCCCGAACGGTTTCCTGGTTTATTTCTCTGACCACGGTGAAGAGGTTTACGACACGCCGCCGcac  <  1:1046146/65‑1 (MQ=255)  aCCCGAACGGTTTCCTGGTTTATTTCTCTGACCACGGTGAAGAGGTTTACGACACGCCGCCGcac  <  1:1704117/65‑1 (MQ=255)  aCCCGAACGGTTTCCTGGTTTATTTCTCTGACCACGGTGAAGAGGTTTACGACACGCCGCCGcac  <  1:1076440/65‑1 (MQ=255)  aCCCGAACGGTTTCCTGGTTTATTTCTCTGACCACGGTGAAGAGGTTTACGACACGCCGCCGcac  <  1:1120911/65‑1 (MQ=255)  aCCCGAACGGTTTCCTGGTTTATTTCTCTGACCACGGTGAAGAGGTTTACGACACGCCGCCGcac  <  1:1156706/65‑1 (MQ=255)  aCCCGAACGGTTTCCTGGTTTATTTCTCTGACCACGGTGAAGAGGTTTACGACACGCCGCCGcac  <  1:1206243/65‑1 (MQ=255)  aCCCGAACGGTTTCCTGGTTTATTTCTCTGACCACGGTGAAGAGGTTTACGACACGCCGCCGcac  <  1:1318161/65‑1 (MQ=255)  aCCCGAACGGTTTCCTGGTTTATTTCTCTGACCACGGTGAAGAGGTTTACGACACGCCGCCGcac  <  1:1324833/65‑1 (MQ=255)  aCCCGAACGGTTTCCTGGTTTATTTCTCTGACCACGGTGAAGAGGTTTACGACACGCCGCCGcac  <  1:133469/65‑1 (MQ=255)  aCCCGAACGGTTTCCTGGTTTATTTCTCTGACCACGGTGAAGAGGTTTACGACACGCCGCCGcac  <  1:1382008/65‑1 (MQ=255)  aCCCGAACGGTTTCCTGGTTTATTTCTCTGACCACGGTGAAGAGGTTTACGACACGCCGCCGcac  <  1:1388969/65‑1 (MQ=255)  aCCCGAACGGTTTCCTGGTTTATTTCTCTGACCACGGTGAAGAGGTTTACGACACGCCGCCGcac  <  1:1427647/65‑1 (MQ=255)  aCCCGAACGGTTTCCTGGTTTATTTCTCTGACCACGGTGAAGAGGTTTACGACACGCCGCCGcac  <  1:1432848/65‑1 (MQ=255)  aCCCGAACGGTTTCCTGGTTTATTTCTCTGACCACGGTGAAGAGGTTTACGACACGCCGCCGcac  <  1:1455752/65‑1 (MQ=255)  aCCCGAACGGTTTCCTGGTTTATTTCTCTGACCACGGTGAAGAGGTTTACGACACGCCGCCGcac  <  1:1530895/65‑1 (MQ=255)  aCCCGAACGGTTTCCTGGTTTATTTCTCTGACCACGGTGAAGAGGTTTACGACACGCCGCCGcac  <  1:1611953/65‑1 (MQ=255)  aCCCGAACGGTTTCCTGGTTTATTTCTCTGACCACGGTGAAGAGGTTTACGACACGCCGCCGcac  <  1:1645680/65‑1 (MQ=255)  aCCCGAACGGTTTCCTGGTTTATTTCTCTGACCACGGTGAAGAGGTTTACGACACGCCGCCGcac  <  1:1653580/65‑1 (MQ=255)  aCCCGAACGGTTTCCTGGTTTATTTCTCTGACCACGGTGAAGAGGTTTACGACACGCCGCCGcac  <  1:1756909/65‑1 (MQ=255)   cccGAACGGTTTCCTGGTTTATTTCTCTGACCACGGTGAAGAGGTTTACGACACGCCGCCGcac  <  1:749117/64‑1 (MQ=255)   cccGAACGGTTTCCTGGTTTATTTCTCTGACCACGGTGAAGAGGTTTACGACACGCCGCCGcac  <  1:1312660/64‑1 (MQ=255)   cccGAACGGTTTCCTGGTTTATTTCTCTGACCACGGTGAAGAGGTTTACGACACGCCGCCGcac  <  1:1291946/64‑1 (MQ=255)              tCCTGGTTTATTTCTCTGACCACGGTGAAGAGGTTTACGACACGCCGCCGcac  <  1:60934/53‑1 (MQ=255)                                                                  | AACCCGAACGGTTTCCTGGTTTATTTCTCTGACCACGGTGAAGAGGTTTACGACACGCCGCCGCAC  >  W3110S.gb/3487766‑3487831

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑