Missing coverage evidence...
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CTGCCGCAATGTTTACATCGAACTCCCCTCAGGCCACACTTTTCAGGTGGCCTTTTTTAATAAT  >  W3110S.gb/3488259‑3488322                                                                | ctcccGCAATGTTTACATCGAACTCCCCTCAGGCCACACTTTTCAGGTGGCCTTTTTTaataat  >  1:243721/4‑64 (MQ=255) cTGCCGCAATGTTTACATCGCACTCCCCTCAGGCCACACTTTTCAGGTGGCCTTTTTTaataat  >  1:875004/1‑64 (MQ=255) cTGCCGCAATGTTTACATCGAACTCCCCTCAGGCCACACTTTTCAGGTGGCCTTTTTTaataat  >  1:996547/1‑64 (MQ=255) cTGCCGCAATGTTTACATCGAACTCCCCTCAGGCCACACTTTTCAGGTGGCCTTTTTTaataat  >  1:338287/1‑64 (MQ=255) cTGCCGCAATGTTTACATCGAACTCCCCTCAGGCCACACTTTTCAGGTGGCCTTTTTTaataat  >  1:1627246/1‑64 (MQ=255) cTGCCGCAATGTTTACATCGAACTCCCCTCAGGCCACACTTTTCAGGTGGCCTTTTTTaataat  >  1:1155643/1‑64 (MQ=255)  tGCCGCAATGTTTACATCGAACTCCCCTCAGGCCCCACTTTTCAGGTGGCCTTTTTTaataat  >  1:496258/1‑63 (MQ=255)  tGCCGCAATGTTTACATCGAACTCCCCTCAGGCCACACTTTTCAGGTGGCCTTTTTTaataat  >  1:1833136/1‑63 (MQ=255)  tGCCGCAATGTTTACATCGAACTCCCCTCAGGCCACACTTTTCAGGTGGCCTTTTTTaataat  >  1:817905/1‑63 (MQ=255)  tGCCGCAATGTTTACATCGAACTCCCCTCAGGCCACACTTTTCAGGTGGCCTTTTTTaataat  >  1:262115/1‑63 (MQ=255)  tGCCGCAATGTTTACATCGAACTCCCCTCAGGCCACACTTTTCAGGTGGCCTTTTTTaataat  >  1:280508/1‑63 (MQ=255)  tGCCGCAATGTTTACATCGAACTCCCCTCAGGCCACACTTTTCAGGTGGCCTTTTTTaataat  >  1:311698/1‑63 (MQ=255)  tGCCGCAATGTTTACATCGAACTCCCCTCAGGCCACACTTTTCAGGTGGCCTTTTTTaataat  >  1:906042/1‑63 (MQ=255)  tGCCGCAATGTTTACATCGAACTCCCCTCAGGCCACACTTTTCAGGTGGCCTTTTTTaataat  >  1:408045/1‑63 (MQ=255)  tGCCGCAATGTTTACATCGAACTCCCCTCAGGCCACACTTTTCAGGTGGCCTTTTTTaataat  >  1:471046/1‑63 (MQ=255)  tGCCGCAATGTTTACATCGAACTCCCCTCAGGCCACACTTTTCAGGTGGCCTTTTTTaataat  >  1:593683/1‑63 (MQ=255)  tGCCGCAATGTTTACATCGAACTCCCCTCAGGCCACACTTTTCAGGTGGCCTTTTTTaataat  >  1:645609/1‑63 (MQ=255)  tGCCGCAATGTTTACATCGAACTCCCCTCAGGCCACACTTTTCAGGTGGCCTTTTTTaataat  >  1:684625/1‑63 (MQ=255)  tGCCGCAATGTTTACATCGAACTCCCCTCAGGCCACACTTTTCAGGTGGCCTTTTTTaataat  >  1:710452/1‑63 (MQ=255)  tGCCGCAATGTTTACATCGAACTCCCCTCAGGCCACACTTTTCAGGTGGCCTTTTTTaataat  >  1:749705/1‑63 (MQ=255)  tGCCGCAATGTTTACATCGAACTCCCCTCAGGCCACACTTTTCAGGTGGCCTTTTTTaataat  >  1:755289/1‑63 (MQ=255)  tGCCGCAATGTTTACATCGAACTCCCCTCAGGCCACACTTTTCAGGTGGCCTTTTTTaataat  >  1:781420/1‑63 (MQ=255)  tGCCGCAATGTTTACATCGAACTCCCCTCAGGCCACACTTTTCAGGTGGCCTTTTTTaataat  >  1:1541437/1‑63 (MQ=255)  tGCCGCAATGTTTACATCGAACTCCCCTCAGGCCACACTTTTCAGGTGGCCTTTTTTaataat  >  1:1044492/1‑63 (MQ=255)  tGCCGCAATGTTTACATCGAACTCCCCTCAGGCCACACTTTTCAGGTGGCCTTTTTTaataat  >  1:1068220/1‑63 (MQ=255)  tGCCGCAATGTTTACATCGAACTCCCCTCAGGCCACACTTTTCAGGTGGCCTTTTTTaataat  >  1:1144904/1‑63 (MQ=255)  tGCCGCAATGTTTACATCGAACTCCCCTCAGGCCACACTTTTCAGGTGGCCTTTTTTaataat  >  1:1176251/1‑63 (MQ=255)  tGCCGCAATGTTTACATCGAACTCCCCTCAGGCCACACTTTTCAGGTGGCCTTTTTTaataat  >  1:1319108/1‑63 (MQ=255)  tGCCGCAATGTTTACATCGAACTCCCCTCAGGCCACACTTTTCAGGTGGCCTTTTTTaataat  >  1:1323027/1‑63 (MQ=255)  tGCCGCAATGTTTACATCGAACTCCCCTCAGGCCACACTTTTCAGGTGGCCTTTTTTaataat  >  1:1397282/1‑63 (MQ=255)  tGCCGCAATGTTTACATCGAACTCCCCTCAGGCCACACTTTTCAGGTGGCCTTTTTTaataat  >  1:1411764/1‑63 (MQ=255)  tGCCGCAATGTTTACATCGAACTCCCCTCAGGCCACACTTTTCAGGTGGCCTTTTTTaataat  >  1:1435366/1‑63 (MQ=255)  tGCCGCAATGTTTACATCGAACTCCCCTCAGGCCACACTTTTCAGGTGGCCTTTTTTaataat  >  1:1474382/1‑63 (MQ=255)  tGCCGCAATGTTTACATCGAACTCCCCTCAGGCCACACTTTTCAGGTGGCCTTTTTTaataat  >  1:197546/1‑63 (MQ=255)  tGCCGCAATGTTTACATCGAACTCCCCTCAGGCCACACTTTTCAGGTGGCCTTTTTTaataat  >  1:1541496/1‑63 (MQ=255)  tGCCGCAATGTTTACATCGAACTCCCCTCAGGCCACACTTTTCAGGTGGCCTTTTTTaataat  >  1:1581863/1‑63 (MQ=255)  tGCCGCAATGTTTACATCGAACTCCCCTCAGGCCACACTTTTCAGGTGGCCTTTTTTaataat  >  1:1590676/1‑63 (MQ=255)  tGCCGCAATGTTTACATCGAACTCCCCTCAGGCCACACTTTTCAGGTGGCCTTTTTTaataat  >  1:16800/1‑63 (MQ=255)  tGCCGCAATGTTTACATCGAACTCCCCTCAGGCCACACTTTTCAGGTGGCCTTTTTTaataat  >  1:1725424/1‑63 (MQ=255)  tGCCGCAATGTTTACATCGAACTCCCCTCAGGCCACACTTTTCAGGTGGCCTTTTTTaataat  >  1:1742075/1‑63 (MQ=255)  tGCCGCAATGTTTACATCGAACTCCCCTCAGGCCACACTTTTCAGGTGGCCTTTTTTaataat  >  1:1742821/1‑63 (MQ=255)  tGCCGCAATGTTTACATCGAACTCCCCTCAGGCCACACTTTTCAGGTGGCCTTTTTTaataat  >  1:10393/1‑63 (MQ=255)  tGCCGCAATGTTTACATCGAACTCCCCTCAGGCCACACTTTTCACGTGGCCTTTTTTaataat  >  1:317596/1‑63 (MQ=255)                                                                | CTGCCGCAATGTTTACATCGAACTCCCCTCAGGCCACACTTTTCAGGTGGCCTTTTTTAATAAT  >  W3110S.gb/3488259‑3488322

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑