Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 313059 313345 287 173 [0] [0] 41 ykgM/eaeH predicted ribosomal protein/attaching and effacing protein, pathogenesis factor

Only 100 of 173 total aligned reads displayed.

TAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTAA  >  W3110S.gb/312994‑313058
                                                                |
tAGTTTATCCGGAATTGTTAATTCATTAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACTTaa  <  1:856477/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:289334/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:555807/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:521496/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:519640/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:48284/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:470891/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:465545/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:459918/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:418288/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:38682/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:379389/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:375757/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:321638/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:587924/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:28235/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:276138/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:246730/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:219335/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:216312/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:188332/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:1869929/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:1849291/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:1007739/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:1778634/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:78468/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:972423/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:953221/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:951152/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:94763/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:924845/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:897243/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:884748/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:838123/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:827413/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:802707/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:800138/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:559865/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:754529/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:724106/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:710733/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:700107/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:698055/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:670990/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:633038/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:628776/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:610047/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:588465/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:1823104/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:1223363/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:1769362/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:1415036/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:141015/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:1398878/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:1365055/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:1338354/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:1336944/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:1305937/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:130087/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:1289018/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:12784/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:143804/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:1209563/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:1207842/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:1166714/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:1153019/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:1125465/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:1118658/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:1108760/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:1097616/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:1087311/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:1046049/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:1009868/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:1625621/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:1753783/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:1749616/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:1745446/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:1739089/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:1701661/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:1676792/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:1672033/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:1662811/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:1658587/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:1644095/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:1445381/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:1600778/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:1591950/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:1589507/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:1557453/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:1551698/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:1541876/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:1537680/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:1509599/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:1481949/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:1468207/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATAAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:747749/65‑1 (MQ=255)
tAGTTTATCCGGAATGCTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:1850333/65‑1 (MQ=255)
                      tCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:646019/43‑1 (MQ=255)
                            aCAAGTTGTGATATCGTTCATGAGTAGCATAACGTaa  <  1:1730529/37‑1 (MQ=38)
                              aaGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTaa  <  1:1086819/35‑1 (MQ=255)
                                                                |
TAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTAA  >  W3110S.gb/312994‑313058

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑