Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3517669	3517713	45	40 [0]	[0] 63	rraA	ribonuclease E (RNase E) inhibitor protein

ATGAATGGGAAGGTCTGGTCATTTACGGCGCGGTGCGTCAGGTAGATGACCTGGAAGAGTTGGAT  >  W3110S.gb/3517604‑3517668                                                                 | atgaatgGGAAGGTCTGGTCATTTACGGCGCGGTGCGTCAGGTAGATGACCTGGAAGAGTTGGat  >  1:539495/1‑65 (MQ=255) atgaatgGGAAGGTCTGGTCATTTACGGCGCGGTGCGTCAGGTAGATGACCTGGAAGAGTTGGat  >  1:1774596/1‑65 (MQ=255) atgaatgGGAAGGTCTGGTCATTTACGGCGCGGTGCGTCAGGTAGATGACCTGGAAGAGTTGGat  >  1:1800633/1‑65 (MQ=255) atgaatgGGAAGGTCTGGTCATTTACGGCGCGGTGCGTCAGGTAGATGACCTGGAAGAGTTGGat  >  1:182081/1‑65 (MQ=255) atgaatgGGAAGGTCTGGTCATTTACGGCGCGGTGCGTCAGGTAGATGACCTGGAAGAGTTGGat  >  1:21547/1‑65 (MQ=255) atgaatgGGAAGGTCTGGTCATTTACGGCGCGGTGCGTCAGGTAGATGACCTGGAAGAGTTGGat  >  1:252659/1‑65 (MQ=255) atgaatgGGAAGGTCTGGTCATTTACGGCGCGGTGCGTCAGGTAGATGACCTGGAAGAGTTGGat  >  1:256832/1‑65 (MQ=255) atgaatgGGAAGGTCTGGTCATTTACGGCGCGGTGCGTCAGGTAGATGACCTGGAAGAGTTGGat  >  1:295305/1‑65 (MQ=255) atgaatgGGAAGGTCTGGTCATTTACGGCGCGGTGCGTCAGGTAGATGACCTGGAAGAGTTGGat  >  1:33700/1‑65 (MQ=255) atgaatgGGAAGGTCTGGTCATTTACGGCGCGGTGCGTCAGGTAGATGACCTGGAAGAGTTGGat  >  1:475388/1‑65 (MQ=255) atgaatgGGAAGGTCTGGTCATTTACGGCGCGGTGCGTCAGGTAGATGACCTGGAAGAGTTGGat  >  1:1727141/1‑65 (MQ=255) atgaatgGGAAGGTCTGGTCATTTACGGCGCGGTGCGTCAGGTAGATGACCTGGAAGAGTTGGat  >  1:544700/1‑65 (MQ=255) atgaatgGGAAGGTCTGGTCATTTACGGCGCGGTGCGTCAGGTAGATGACCTGGAAGAGTTGGat  >  1:608452/1‑65 (MQ=255) atgaatgGGAAGGTCTGGTCATTTACGGCGCGGTGCGTCAGGTAGATGACCTGGAAGAGTTGGat  >  1:620051/1‑65 (MQ=255) atgaatgGGAAGGTCTGGTCATTTACGGCGCGGTGCGTCAGGTAGATGACCTGGAAGAGTTGGat  >  1:633080/1‑65 (MQ=255) atgaatgGGAAGGTCTGGTCATTTACGGCGCGGTGCGTCAGGTAGATGACCTGGAAGAGTTGGat  >  1:706196/1‑65 (MQ=255) atgaatgGGAAGGTCTGGTCATTTACGGCGCGGTGCGTCAGGTAGATGACCTGGAAGAGTTGGat  >  1:771248/1‑65 (MQ=255) atgaatgGGAAGGTCTGGTCATTTACGGCGCGGTGCGTCAGGTAGATGACCTGGAAGAGTTGGat  >  1:793994/1‑65 (MQ=255) atgaatgGGAAGGTCTGGTCATTTACGGCGCGGTGCGTCAGGTAGATGACCTGGAAGAGTTGGat  >  1:812016/1‑65 (MQ=255) atgaatgGGAAGGTCTGGTCATTTACGGCGCGGTGCGTCAGGTAGATGACCTGGAAGAGTTGGat  >  1:894994/1‑65 (MQ=255) atgaatgGGAAGGTCTGGTCATTTACGGCGCGGTGCGTCAGGTAGATGACCTGGAAGAGTTGGat  >  1:1428725/1‑65 (MQ=255) atgaatgGGAAGGTCTGGTCATTTACGGCGCGGTGCGTCAGGTAGATGACCTGGAAGAGTTGGat  >  1:1067198/1‑65 (MQ=255) atgaatgGGAAGGTCTGGTCATTTACGGCGCGGTGCGTCAGGTAGATGACCTGGAAGAGTTGGat  >  1:1095714/1‑65 (MQ=255) atgaatgGGAAGGTCTGGTCATTTACGGCGCGGTGCGTCAGGTAGATGACCTGGAAGAGTTGGat  >  1:1105988/1‑65 (MQ=255) atgaatgGGAAGGTCTGGTCATTTACGGCGCGGTGCGTCAGGTAGATGACCTGGAAGAGTTGGat  >  1:1114266/1‑65 (MQ=255) atgaatgGGAAGGTCTGGTCATTTACGGCGCGGTGCGTCAGGTAGATGACCTGGAAGAGTTGGat  >  1:1159099/1‑65 (MQ=255) atgaatgGGAAGGTCTGGTCATTTACGGCGCGGTGCGTCAGGTAGATGACCTGGAAGAGTTGGat  >  1:1245425/1‑65 (MQ=255) atgaatgGGAAGGTCTGGTCATTTACGGCGCGGTGCGTCAGGTAGATGACCTGGAAGAGTTGGat  >  1:1257580/1‑65 (MQ=255) atgaatgGGAAGGTCTGGTCATTTACGGCGCGGTGCGTCAGGTAGATGACCTGGAAGAGTTGGat  >  1:1299650/1‑65 (MQ=255) atgaatgGGAAGGTCTGGTCATTTACGGCGCGGTGCGTCAGGTAGATGACCTGGAAGAGTTGGat  >  1:1375154/1‑65 (MQ=255) atgaatgGGAAGGTCTGGTCATTTACGGCGCGGTGCGTCAGGTAGATGACCTGGAAGAGTTGGat  >  1:1023808/1‑65 (MQ=255) atgaatgGGAAGGTCTGGTCATTTACGGCGCGGTGCGTCAGGTAGATGACCTGGAAGAGTTGGat  >  1:1440863/1‑65 (MQ=255) atgaatgGGAAGGTCTGGTCATTTACGGCGCGGTGCGTCAGGTAGATGACCTGGAAGAGTTGGat  >  1:1464797/1‑65 (MQ=255) atgaatgGGAAGGTCTGGTCATTTACGGCGCGGTGCGTCAGGTAGATGACCTGGAAGAGTTGGat  >  1:1503083/1‑65 (MQ=255) atgaatgGGAAGGTCTGGTCATTTACGGCGCGGTGCGTCAGGTAGATGACCTGGAAGAGTTGGat  >  1:1509649/1‑65 (MQ=255) atgaatgGGAAGGTCTGGTCATTTACGGCGCGGTGCGTCAGGTAGATGACCTGGAAGAGTTGGat  >  1:1573441/1‑65 (MQ=255) atgaatgGGAAGGTCTGGTCATTTACGGCGCGGTGCGTCAGGTAGATGACCTGGAAGAGTTGGat  >  1:1676725/1‑65 (MQ=255) atgaatgGGAAGGTCTGGTCATTTACGGCGCGGTGCGTCAGGTAGATGACCTGGAAGAGTTGGat  >  1:1699445/1‑65 (MQ=255) atgaatgGGAAGGTCTGGTCATTTACGGCGCGGTGCGTCAGGTAGATGACCTGGAAGAGTTGGat  >  1:1725039/1‑65 (MQ=255) atgaatgGGAAGGTCTGGTCATTTACGGCGCGGTGCGTCAGGTAGATGACCTGGAAGAGTTGGat  >  1:17269/1‑65 (MQ=255)                                                                 | ATGAATGGGAAGGTCTGGTCATTTACGGCGCGGTGCGTCAGGTAGATGACCTGGAAGAGTTGGAT  >  W3110S.gb/3517604‑3517668

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑