Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3524133	3524165	33	14 [0]	[0] 107	yiiR	conserved inner membrane protein

GCCCATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCAGTTACCCGCCAGCAGCATCCACGCCACAATCAT  >  W3110S.gb/3524068‑3524132                                                                 | gCCCATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCAGTTACCCGCCAGCAGCATCCACGCCACAattat  <  1:1563/65‑1 (MQ=255) gCCCATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCAGTTACCCGCCAGCAGCATCCACGCCACAatcat  <  1:1005682/65‑1 (MQ=255) gCCCATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCAGTTACCCGCCAGCAGCATCCACGCCACAatcat  <  1:1271788/65‑1 (MQ=255) gCCCATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCAGTTACCCGCCAGCAGCATCCACGCCACAatcat  <  1:379630/65‑1 (MQ=255) gCCCATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCAGTTACCCGCCAGCAGCATCCACGCCACAatcat  <  1:609603/65‑1 (MQ=255)  cccATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCAGTTACCCGCCAGCAGCATCCACGCCACAatcat  <  1:1144747/64‑1 (MQ=255)  cccATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCAGTTACCCGCCAGCAGCATCCACGCCACAatcat  <  1:1197388/64‑1 (MQ=255)  cccATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCAGTTACCCGCCAGCAGCATCCACGCCACAatcat  <  1:17286/64‑1 (MQ=255)  cccATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCAGTTACCCGCCAGCAGCATCCACGCCACAatcat  <  1:1804946/64‑1 (MQ=255)  cccATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCAGTTACCCGCCAGCAGCATCCACGCCACAatcat  <  1:715541/64‑1 (MQ=255)  cccATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCAGTTACCCGCCAGCAGCATCCACGCCACAatcat  <  1:856484/64‑1 (MQ=255)  cccATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCAGTTACCCGCCAGCAGCATCCACGCCACAatcat  <  1:972389/64‑1 (MQ=255)   ccATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCAGTTACCCGCCAGCAGCATCCACGCCACAatcat  <  1:1111294/63‑1 (MQ=255)                      aaaaTCGCCCAGTTACCCGCCAGCAGCATCCACGCCACAatcat  <  1:1139280/44‑1 (MQ=255)                                                                 | GCCCATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCAGTTACCCGCCAGCAGCATCCACGCCACAATCAT  >  W3110S.gb/3524068‑3524132

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑