Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3532981	3533093	113	23 [0]	[0] 44	[cpxA]	[cpxA]

CGATGAAGCACGCGATCGTGAATCTGGCGGTACAGGTTTGGGGCTGGCGATTGTTGAA  >  W3110S.gb/3532923‑3532980                                                          | cGATGAAGCACGCGATCGTGAATCTGGCGGTACAGGTTTGGGGCTGGCGATTGTTGaa  >  1:265975/1‑58 (MQ=255) cGATGAAGCACGCGATCGTGAATCTGGCGGTACAGGTTTGGGGCTGGCGATTGTTGaa  >  1:977209/1‑58 (MQ=255) cGATGAAGCACGCGATCGTGAATCTGGCGGTACAGGTTTGGGGCTGGCGATTGTTGaa  >  1:862613/1‑58 (MQ=255) cGATGAAGCACGCGATCGTGAATCTGGCGGTACAGGTTTGGGGCTGGCGATTGTTGaa  >  1:726296/1‑58 (MQ=255) cGATGAAGCACGCGATCGTGAATCTGGCGGTACAGGTTTGGGGCTGGCGATTGTTGaa  >  1:688454/1‑58 (MQ=255) cGATGAAGCACGCGATCGTGAATCTGGCGGTACAGGTTTGGGGCTGGCGATTGTTGaa  >  1:651272/1‑58 (MQ=255) cGATGAAGCACGCGATCGTGAATCTGGCGGTACAGGTTTGGGGCTGGCGATTGTTGaa  >  1:628072/1‑58 (MQ=255) cGATGAAGCACGCGATCGTGAATCTGGCGGTACAGGTTTGGGGCTGGCGATTGTTGaa  >  1:590999/1‑58 (MQ=255) cGATGAAGCACGCGATCGTGAATCTGGCGGTACAGGTTTGGGGCTGGCGATTGTTGaa  >  1:545085/1‑58 (MQ=255) cGATGAAGCACGCGATCGTGAATCTGGCGGTACAGGTTTGGGGCTGGCGATTGTTGaa  >  1:449253/1‑58 (MQ=255) cGATGAAGCACGCGATCGTGAATCTGGCGGTACAGGTTTGGGGCTGGCGATTGTTGaa  >  1:428190/1‑58 (MQ=255) cGATGAAGCACGCGATCGTGAATCTGGCGGTACAGGTTTGGGGCTGGCGATTGTTGaa  >  1:416830/1‑58 (MQ=255) cGATGAAGCACGCGATCGTGAATCTGGCGGTACAGGTTTGGGGCTGGCGATTGTTGaa  >  1:1029233/1‑58 (MQ=255) cGATGAAGCACGCGATCGTGAATCTGGCGGTACAGGTTTGGGGCTGGCGATTGTTGaa  >  1:249573/1‑58 (MQ=255) cGATGAAGCACGCGATCGTGAATCTGGCGGTACAGGTTTGGGGCTGGCGATTGTTGaa  >  1:1884792/1‑58 (MQ=255) cGATGAAGCACGCGATCGTGAATCTGGCGGTACAGGTTTGGGGCTGGCGATTGTTGaa  >  1:1856149/1‑58 (MQ=255) cGATGAAGCACGCGATCGTGAATCTGGCGGTACAGGTTTGGGGCTGGCGATTGTTGaa  >  1:1670570/1‑58 (MQ=255) cGATGAAGCACGCGATCGTGAATCTGGCGGTACAGGTTTGGGGCTGGCGATTGTTGaa  >  1:1557635/1‑58 (MQ=255) cGATGAAGCACGCGATCGTGAATCTGGCGGTACAGGTTTGGGGCTGGCGATTGTTGaa  >  1:1549791/1‑58 (MQ=255) cGATGAAGCACGCGATCGTGAATCTGGCGGTACAGGTTTGGGGCTGGCGATTGTTGaa  >  1:1514131/1‑58 (MQ=255) cGATGAAGCACGCGATCGTGAATCTGGCGGTACAGGTTTGGGGCTGGCGATTGTTGaa  >  1:1202424/1‑58 (MQ=255) cGATGAAGCACGCGATCGTGAATCTGGCGGTACAGGTTTGGGGCTGGCGATTGTTGaa  >  1:1165852/1‑58 (MQ=255) cGATGAAGCACGCGATCGTGAATCTGGCGGTACAGGTTTGGGGCTGGCGATTGTTGaa  >  1:104315/1‑58 (MQ=255)                                                          | CGATGAAGCACGCGATCGTGAATCTGGCGGTACAGGTTTGGGGCTGGCGATTGTTGAA  >  W3110S.gb/3532923‑3532980

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑