Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	3537840	3537906	67	41 [0]	[0] 56	rhaR	DNA‑binding transcriptional activator, L‑rhamnose‑binding

AATATTCTGCAAAACCAGATCGTTAACGGAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTAAA  >  W3110S.gb/3537775‑3537839                                                                 | aataTTCTGCAAAACCAGATCGTTAACGGAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTaaa  <  1:423743/65‑1 (MQ=255) aataTTCTGCAAAACCAGATCGTTAACGGAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTaaa  <  1:1717/65‑1 (MQ=255) aataTTCTGCAAAACCAGATCGTTAACGGAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTaaa  <  1:1090323/65‑1 (MQ=255) aataTTCTGCAAAACCAGATCGTTAACGGAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTaaa  <  1:1796434/65‑1 (MQ=255) aataTTCTGCAAAACCAGATCGTTAACGGAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTaaa  <  1:1805008/65‑1 (MQ=255) aataTTCTGCAAAACCAGATCGTTAACGGAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTaaa  <  1:1881230/65‑1 (MQ=255) aataTTCTGCAAAACCAGATCGTTAACGGAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTaaa  <  1:19783/65‑1 (MQ=255) aataTTCTGCAAAACCAGATCGTTAACGGAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTaaa  <  1:2951/65‑1 (MQ=255) aataTTCTGCAAAACCAGATCGTTAACGGAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTaaa  <  1:301691/65‑1 (MQ=255) aataTTCTGCAAAACCAGATCGTTAACGGAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTaaa  <  1:386563/65‑1 (MQ=255) aataTTCTGCAAAACCAGATCGTTAACGGAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTaaa  <  1:1726147/65‑1 (MQ=255) aataTTCTGCAAAACCAGATCGTTAACGGAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTaaa  <  1:498895/65‑1 (MQ=255) aataTTCTGCAAAACCAGATCGTTAACGGAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTaaa  <  1:501939/65‑1 (MQ=255) aataTTCTGCAAAACCAGATCGTTAACGGAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTaaa  <  1:627437/65‑1 (MQ=255) aataTTCTGCAAAACCAGATCGTTAACGGAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTaaa  <  1:691308/65‑1 (MQ=255) aataTTCTGCAAAACCAGATCGTTAACGGAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTaaa  <  1:759813/65‑1 (MQ=255) aataTTCTGCAAAACCAGATCGTTAACGGAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTaaa  <  1:770738/65‑1 (MQ=255) aataTTCTGCAAAACCAGATCGTTAACGGAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTaaa  <  1:781411/65‑1 (MQ=255) aataTTCTGCAAAACCAGATCGTTAACGGAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTaaa  <  1:869038/65‑1 (MQ=255) aataTTCTGCAAAACCAGATCGTTAACGGAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTaaa  <  1:1392840/65‑1 (MQ=255) aataTTCTGCAAAACCAGATCGTTAACGGAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTaaa  <  1:1131137/65‑1 (MQ=255) aataTTCTGCAAAACCAGATCGTTAACGGAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTaaa  <  1:1139893/65‑1 (MQ=255) aataTTCTGCAAAACCAGATCGTTAACGGAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTaaa  <  1:1192559/65‑1 (MQ=255) aataTTCTGCAAAACCAGATCGTTAACGGAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTaaa  <  1:1221713/65‑1 (MQ=255) aataTTCTGCAAAACCAGATCGTTAACGGAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTaaa  <  1:1262168/65‑1 (MQ=255) aataTTCTGCAAAACCAGATCGTTAACGGAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTaaa  <  1:1278631/65‑1 (MQ=255) aataTTCTGCAAAACCAGATCGTTAACGGAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTaaa  <  1:1371938/65‑1 (MQ=255) aataTTCTGCAAAACCAGATCGTTAACGGAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTaaa  <  1:170159/65‑1 (MQ=255) aataTTCTGCAAAACCAGATCGTTAACGGAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTaaa  <  1:1393614/65‑1 (MQ=255) aataTTCTGCAAAACCAGATCGTTAACGGAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTaaa  <  1:1432828/65‑1 (MQ=255) aataTTCTGCAAAACCAGATCGTTAACGGAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTaaa  <  1:1450508/65‑1 (MQ=255) aataTTCTGCAAAACCAGATCGTTAACGGAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTaaa  <  1:1458705/65‑1 (MQ=255) aataTTCTGCAAAACCAGATCGTTAACGGAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTaaa  <  1:1494464/65‑1 (MQ=255) aataTTCTGCAAAACCAGATCGTTAACGGAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTaaa  <  1:1643927/65‑1 (MQ=255) aataTTCTGCAAAACCAGATCGTTAACGGAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTaaa  <  1:1656741/65‑1 (MQ=255) aataTTCTGCAAAACCAGATCGTTAACGGAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTaaa  <  1:1700215/65‑1 (MQ=255)  atatTCTGCAAAACCAGATCGTTAACGGAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTaaa  <  1:689464/64‑1 (MQ=255)  atatTCTGCAAAACCAGATCGTTAACGGAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTaaa  <  1:718625/64‑1 (MQ=255)                       ttAACGGAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTaaa  <  1:720990/43‑1 (MQ=255)                       ttAACGGAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTaaa  <  1:1531543/43‑1 (MQ=255)                            ggAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTaaa  <  1:349262/38‑1 (MQ=255)                                                                 | AATATTCTGCAAAACCAGATCGTTAACGGAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTAAA  >  W3110S.gb/3537775‑3537839

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑