Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	3540617	3540779	163	37 [0]	[0] 8	[rhaB]–[rhaA]	[rhaB],[rhaA]

GCTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGCACCACCGCGAATCTGACCA  >  W3110S.gb/3540552‑3540616                                                                 | gCTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGTACCACCGCGAATCTGacca  <  1:1702289/65‑1 (MQ=255) gCTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGCACCACCGCGAATCTGacca  <  1:402548/65‑1 (MQ=255) gCTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGCACCACCGCGAATCTGacca  <  1:1082487/65‑1 (MQ=255) gCTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGCACCACCGCGAATCTGacca  <  1:183277/65‑1 (MQ=255) gCTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGCACCACCGCGAATCTGacca  <  1:225946/65‑1 (MQ=255) gCTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGCACCACCGCGAATCTGacca  <  1:240949/65‑1 (MQ=255) gCTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGCACCACCGCGAATCTGacca  <  1:273225/65‑1 (MQ=255) gCTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGCACCACCGCGAATCTGacca  <  1:347961/65‑1 (MQ=255) gCTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGCACCACCGCGAATCTGacca  <  1:363433/65‑1 (MQ=255) gCTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGCACCACCGCGAATCTGacca  <  1:173067/65‑1 (MQ=255) gCTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGCACCACCGCGAATCTGacca  <  1:424990/65‑1 (MQ=255) gCTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGCACCACCGCGAATCTGacca  <  1:426846/65‑1 (MQ=255) gCTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGCACCACCGCGAATCTGacca  <  1:463088/65‑1 (MQ=255) gCTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGCACCACCGCGAATCTGacca  <  1:566536/65‑1 (MQ=255) gCTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGCACCACCGCGAATCTGacca  <  1:576354/65‑1 (MQ=255) gCTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGCACCACCGCGAATCTGacca  <  1:692741/65‑1 (MQ=255) gCTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGCACCACCGCGAATCTGacca  <  1:83669/65‑1 (MQ=255) gCTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGCACCACCGCGAATCTGacca  <  1:894695/65‑1 (MQ=255) gCTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGCACCACCGCGAATCTGacca  <  1:1427797/65‑1 (MQ=255) gCTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGCACCACCGCGAATCTGacca  <  1:1171847/65‑1 (MQ=255) gCTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGCACCACCGCGAATCTGacca  <  1:1196364/65‑1 (MQ=255) gCTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGCACCACCGCGAATCTGacca  <  1:1248267/65‑1 (MQ=255) gCTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGCACCACCGCGAATCTGacca  <  1:1250427/65‑1 (MQ=255) gCTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGCACCACCGCGAATCTGacca  <  1:1273563/65‑1 (MQ=255) gCTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGCACCACCGCGAATCTGacca  <  1:1348796/65‑1 (MQ=255) gCTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGCACCACCGCGAATCTGacca  <  1:1402132/65‑1 (MQ=255) gCTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGCACCACCGCGAATCTGacca  <  1:1440710/65‑1 (MQ=255) gCTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGCACCACCGCGAATCTGacca  <  1:1454839/65‑1 (MQ=255) gCTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGCACCACCGCGAATCTGacca  <  1:1457006/65‑1 (MQ=255) gCTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGCACCACCGCGAATCTGacca  <  1:1549756/65‑1 (MQ=255) gCTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGCACCACCGCGAATCTGacca  <  1:1561604/65‑1 (MQ=255) gCTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGCACCACCGCGAATCTGacca  <  1:1714732/65‑1 (MQ=255)  cTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGCACCACCGCGAATCTGacca  <  1:1723546/64‑1 (MQ=255)  cTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGCACCACCGCGAATCTGacca  <  1:572463/64‑1 (MQ=255)  cTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGCACCACCGCGAATCTGacca  <  1:1851822/64‑1 (MQ=255)        gAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGGCAGCACCACCGCGAATCTGacca  <  1:1445649/58‑1 (MQ=255)                     tgGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGCACCACCGCGAATCTGacca  <  1:858308/45‑1 (MQ=255)                                                                 | GCTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGCACCACCGCGAATCTGACCA  >  W3110S.gb/3540552‑3540616

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑