Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3549432	3549569	138	21 [0]	[0] 105	yiiG	conserved hypothetical protein

CTTTCAGCCAGTCAGCATAACGCGCCAGACTGCGCTGTACCGGGATCTGTAACTTGTTGTAGCAC  >  W3110S.gb/3549367‑3549431                                                                 | cTTTTAGCCAGTCAGCATAACGCGCCAGACTGCGCTGTACCGGGATCTGTAACTTGTTGTAGCAc  <  1:1287661/65‑1 (MQ=255) cTTTCAGCCAGTCAGCATAACGCGCCAGACTGCGCTGTACCGGGATCTGTAACTTGTTGTAGCAc  <  1:1751028/65‑1 (MQ=255) cTTTCAGCCAGTCAGCATAACGCGCCAGACTGCGCTGTACCGGGATCTGTAACTTGTTGTAGCAc  <  1:982748/65‑1 (MQ=255) cTTTCAGCCAGTCAGCATAACGCGCCAGACTGCGCTGTACCGGGATCTGTAACTTGTTGTAGCAc  <  1:975678/65‑1 (MQ=255) cTTTCAGCCAGTCAGCATAACGCGCCAGACTGCGCTGTACCGGGATCTGTAACTTGTTGTAGCAc  <  1:824533/65‑1 (MQ=255) cTTTCAGCCAGTCAGCATAACGCGCCAGACTGCGCTGTACCGGGATCTGTAACTTGTTGTAGCAc  <  1:647336/65‑1 (MQ=255) cTTTCAGCCAGTCAGCATAACGCGCCAGACTGCGCTGTACCGGGATCTGTAACTTGTTGTAGCAc  <  1:619011/65‑1 (MQ=255) cTTTCAGCCAGTCAGCATAACGCGCCAGACTGCGCTGTACCGGGATCTGTAACTTGTTGTAGCAc  <  1:563954/65‑1 (MQ=255) cTTTCAGCCAGTCAGCATAACGCGCCAGACTGCGCTGTACCGGGATCTGTAACTTGTTGTAGCAc  <  1:558165/65‑1 (MQ=255) cTTTCAGCCAGTCAGCATAACGCGCCAGACTGCGCTGTACCGGGATCTGTAACTTGTTGTAGCAc  <  1:458219/65‑1 (MQ=255) cTTTCAGCCAGTCAGCATAACGCGCCAGACTGCGCTGTACCGGGATCTGTAACTTGTTGTAGCAc  <  1:432637/65‑1 (MQ=255) cTTTCAGCCAGTCAGCATAACGCGCCAGACTGCGCTGTACCGGGATCTGTAACTTGTTGTAGCAc  <  1:234756/65‑1 (MQ=255) cTTTCAGCCAGTCAGCATAACGCGCCAGACTGCGCTGTACCGGGATCTGTAACTTGTTGTAGCAc  <  1:1015137/65‑1 (MQ=255) cTTTCAGCCAGTCAGCATAACGCGCCAGACTGCGCTGTACCGGGATCTGTAACTTGTTGTAGCAc  <  1:1606772/65‑1 (MQ=255) cTTTCAGCCAGTCAGCATAACGCGCCAGACTGCGCTGTACCGGGATCTGTAACTTGTTGTAGCAc  <  1:157286/65‑1 (MQ=255) cTTTCAGCCAGTCAGCATAACGCGCCAGACTGCGCTGTACCGGGATCTGTAACTTGTTGTAGCAc  <  1:1353722/65‑1 (MQ=255) cTTTCAGCCAGTCAGCATAACGCGCCAGACTGCGCTGTACCGGGATCTGTAACTTGTTGTAGCAc  <  1:1259023/65‑1 (MQ=255) cTTTCAGCCAGTCAGCATAACGCGCCAGACTGCGCTGTACCGGGATCTGTAACTTGTTGTAGCAc  <  1:1162141/65‑1 (MQ=255) cTTTCAGCCAGTCAGCATAACGCGCCAGACTGCGCTGTACCGGGATCTGTAACTTGTTGTAGCAc  <  1:11398/65‑1 (MQ=255) cTTTCAGCCAGTCAGCATAACGCGCCAGACTGCGCTGTACCGGGATCTGTAACTTGTTGTAGCAc  <  1:1041198/65‑1 (MQ=255) cTTTCAGCCAGTCAGCATAACGCGCCAGACTGCGCTGTACCGGGATCTGTAACTTGTTGCAGCAc  <  1:1041212/65‑1 (MQ=255)                                                                 | CTTTCAGCCAGTCAGCATAACGCGCCAGACTGCGCTGTACCGGGATCTGTAACTTGTTGTAGCAC  >  W3110S.gb/3549367‑3549431

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑