Missing coverage evidence...
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ACCGTTGACTGGGAAGGAAAACCGGTGGTCCGCGAACGTGTACGTTGGCCTATCGTCGAAGCAA  >  W3110S.gb/3565825‑3565888                                                                | aCCGTTGACTGGGAAGGAAAACCGGTGGTCCGCGAACGTGTACGTTGGCCTATCGTCGAAGCaa  <  1:539735/64‑1 (MQ=255) aCCGTTGACTGGGAAGGAAAACCGGTGGTCCGCGAACGTGTACGTTGGCCTATCGTCGAAGCaa  <  1:1050250/64‑1 (MQ=255) aCCGTTGACTGGGAAGGAAAACCGGTGGTCCGCGAACGTGTACGTTGGCCTATCGTCGAAGCaa  <  1:346609/64‑1 (MQ=255) aCCGTTGACTGGGAAGGAAAACCGGTGGTCCGCGAACGTGTACGTTGGCCTATCGTCGAAGCaa  <  1:347711/64‑1 (MQ=255) aCCGTTGACTGGGAAGGAAAACCGGTGGTCCGCGAACGTGTACGTTGGCCTATCGTCGAAGCaa  <  1:372154/64‑1 (MQ=255) aCCGTTGACTGGGAAGGAAAACCGGTGGTCCGCGAACGTGTACGTTGGCCTATCGTCGAAGCaa  <  1:392196/64‑1 (MQ=255) aCCGTTGACTGGGAAGGAAAACCGGTGGTCCGCGAACGTGTACGTTGGCCTATCGTCGAAGCaa  <  1:473075/64‑1 (MQ=255) aCCGTTGACTGGGAAGGAAAACCGGTGGTCCGCGAACGTGTACGTTGGCCTATCGTCGAAGCaa  <  1:476393/64‑1 (MQ=255) aCCGTTGACTGGGAAGGAAAACCGGTGGTCCGCGAACGTGTACGTTGGCCTATCGTCGAAGCaa  <  1:526311/64‑1 (MQ=255) aCCGTTGACTGGGAAGGAAAACCGGTGGTCCGCGAACGTGTACGTTGGCCTATCGTCGAAGCaa  <  1:339702/64‑1 (MQ=255) aCCGTTGACTGGGAAGGAAAACCGGTGGTCCGCGAACGTGTACGTTGGCCTATCGTCGAAGCaa  <  1:581204/64‑1 (MQ=255) aCCGTTGACTGGGAAGGAAAACCGGTGGTCCGCGAACGTGTACGTTGGCCTATCGTCGAAGCaa  <  1:590319/64‑1 (MQ=255) aCCGTTGACTGGGAAGGAAAACCGGTGGTCCGCGAACGTGTACGTTGGCCTATCGTCGAAGCaa  <  1:768581/64‑1 (MQ=255) aCCGTTGACTGGGAAGGAAAACCGGTGGTCCGCGAACGTGTACGTTGGCCTATCGTCGAAGCaa  <  1:769104/64‑1 (MQ=255) aCCGTTGACTGGGAAGGAAAACCGGTGGTCCGCGAACGTGTACGTTGGCCTATCGTCGAAGCaa  <  1:787180/64‑1 (MQ=255) aCCGTTGACTGGGAAGGAAAACCGGTGGTCCGCGAACGTGTACGTTGGCCTATCGTCGAAGCaa  <  1:836902/64‑1 (MQ=255) aCCGTTGACTGGGAAGGAAAACCGGTGGTCCGCGAACGTGTACGTTGGCCTATCGTCGAAGCaa  <  1:853153/64‑1 (MQ=255) aCCGTTGACTGGGAAGGAAAACCGGTGGTCCGCGAACGTGTACGTTGGCCTATCGTCGAAGCaa  <  1:887515/64‑1 (MQ=255) aCCGTTGACTGGGAAGGAAAACCGGTGGTCCGCGAACGTGTACGTTGGCCTATCGTCGAAGCaa  <  1:1710664/64‑1 (MQ=255) aCCGTTGACTGGGAAGGAAAACCGGTGGTCCGCGAACGTGTACGTTGGCCTATCGTCGAAGCaa  <  1:1162271/64‑1 (MQ=255) aCCGTTGACTGGGAAGGAAAACCGGTGGTCCGCGAACGTGTACGTTGGCCTATCGTCGAAGCaa  <  1:1164581/64‑1 (MQ=255) aCCGTTGACTGGGAAGGAAAACCGGTGGTCCGCGAACGTGTACGTTGGCCTATCGTCGAAGCaa  <  1:1212917/64‑1 (MQ=255) aCCGTTGACTGGGAAGGAAAACCGGTGGTCCGCGAACGTGTACGTTGGCCTATCGTCGAAGCaa  <  1:1264513/64‑1 (MQ=255) aCCGTTGACTGGGAAGGAAAACCGGTGGTCCGCGAACGTGTACGTTGGCCTATCGTCGAAGCaa  <  1:130622/64‑1 (MQ=255) aCCGTTGACTGGGAAGGAAAACCGGTGGTCCGCGAACGTGTACGTTGGCCTATCGTCGAAGCaa  <  1:1384989/64‑1 (MQ=255) aCCGTTGACTGGGAAGGAAAACCGGTGGTCCGCGAACGTGTACGTTGGCCTATCGTCGAAGCaa  <  1:1610212/64‑1 (MQ=255) aCCGTTGACTGGGAAGGAAAACCGGTGGTCCGCGAACGTGTACGTTGGCCTATCGTCGAAGCaa  <  1:318830/64‑1 (MQ=255) aCCGTTGACTGGGAAGGAAAACCGGTGGTCCGCGAACGTGTACGTTGGCCTATCGTCGAAGCaa  <  1:1711653/64‑1 (MQ=255) aCCGTTGACTGGGAAGGAAAACCGGTGGTCCGCGAACGTGTACGTTGGCCTATCGTCGAAGCaa  <  1:1715406/64‑1 (MQ=255) aCCGTTGACTGGGAAGGAAAACCGGTGGTCCGCGAACGTGTACGTTGGCCTATCGTCGAAGCaa  <  1:1791630/64‑1 (MQ=255) aCCGTTGACTGGGAAGGAAAACCGGTGGTCCGCGAACGTGTACGTTGGCCTATCGTCGAAGCaa  <  1:1849095/64‑1 (MQ=255) aCCGTTGACTGGGAAGGAAAACCGGTGGTCCGCGAACGTGTACGTTGGCCTATCGTCGAAGCaa  <  1:206134/64‑1 (MQ=255) aCCGTTGACTGGGAAGGAAAACCGGTGGTCCGCGAACGTGTACGTTGGCCTATCGTCGAAGCaa  <  1:311420/64‑1 (MQ=255) aCCGTTGACTGGGAAGGAAAACCGGTGGTCCGCGAACGTGTACGTTGGCCTATCATCGAAGCaa  <  1:1200402/64‑1 (MQ=255)  ccGTTGACTGGGAAGGAAAACCGGTGGTCCGCGAACGTGTACGTTGGCCTATCGTCGAAGCaa  <  1:486726/63‑1 (MQ=255)  ccGTTGACTGGGAAGGAAAACCGGTGGTCCGCGAACGTGTACGTTGGCCTATCGTCGAAGCaa  <  1:733615/63‑1 (MQ=255)  ccGTTGACTGGGAAGGAAAACCGGTGGTCCGCGAACGTGTACGTTGGCCTATCGTCGAAGCaa  <  1:198238/63‑1 (MQ=255)                                                                | ACCGTTGACTGGGAAGGAAAACCGGTGGTCCGCGAACGTGTACGTTGGCCTATCGTCGAAGCAA  >  W3110S.gb/3565825‑3565888

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑