Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3572269	3572499	231	76 [0]	[0] 34	[yihO]–[ompL]	[yihO],[ompL]

GGGATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCA  >  W3110S.gb/3572204‑3572268                                                                 | gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:219050/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:449311/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:446673/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:432342/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:39372/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:339486/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:336053/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:322039/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:26603/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:48907/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:1823814/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:1808940/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:1760279/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:1708983/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:1702307/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:1677334/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:1675866/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:737334/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:948664/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:938984/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:934458/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:901644/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:859448/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:816612/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:804194/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:751136/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:103872/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:696363/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:677890/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:602830/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:585225/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:560562/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:503653/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:497688/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:1213849/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:1370082/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:1351179/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:1346905/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:109601/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:1294413/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:128878/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:12385/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:1226297/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:1372197/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:1191313/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:1162450/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:1099309/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:1145083/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:1102006/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:1140226/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:1123025/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:1066495/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:1608923/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:1576301/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:1559000/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:1543212/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:1535262/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:1533776/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:1494778/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:1467275/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:1006834/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:146345/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:1432933/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:1431196/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:1376717/65‑1 (MQ=255) gggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCAATGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:1239739/65‑1 (MQ=255)  ggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:990400/64‑1 (MQ=255)  ggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:949288/64‑1 (MQ=255)  ggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:1632339/64‑1 (MQ=255)  ggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:792197/64‑1 (MQ=255)  ggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:748695/64‑1 (MQ=255)  ggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:217885/64‑1 (MQ=255)  ggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:207626/64‑1 (MQ=255)  ggATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:183548/64‑1 (MQ=255)     ttCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:1326782/61‑1 (MQ=255)          ttACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCa  <  1:1372373/56‑1 (MQ=255)                                                                 | GGGATTCTTTTACACACTCAATGAAAAACGGTTTGCATTGATTATTGAGGAAATCAACCAACGCA  >  W3110S.gb/3572204‑3572268

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑