Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 3578933 3578972 40 140 [0] [0] 49 glnA glutamine synthetase

Only 100 of 140 total aligned reads displayed.

CGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTG  >  W3110S.gb/3578868‑3578932
                                                                |
ggCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:720312/64‑1 (MQ=255)
cGCAGTGTTTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:1884919/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTTGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:444341/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:420370/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:606956/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:566593/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:55415/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:529924/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:509549/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:507494/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:492122/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:478801/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:471891/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:467493/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:617597/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:406243/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:405314/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:374179/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:367681/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:34678/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:339398/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:311376/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:306772/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:294465/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:28521/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:1011791/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:826434/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:986827/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:983082/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:944851/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:942922/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:916993/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:907299/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:894421/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:875283/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:859531/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:83789/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:829615/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:242268/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:805602/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:797001/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:7833/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:758816/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:717478/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:712551/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:704350/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:672902/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:638748/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:633148/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:629468/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:1357078/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:1582828/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:1578220/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:224720/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:1541948/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:151525/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:1503932/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:1469917/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:1446968/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:1406960/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:1391862/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:13700/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:1563284/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:1354251/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:1263151/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:1256488/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:1208919/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:118994/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:1160821/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:1129316/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:1123926/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:1053597/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:1021008/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:1773872/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:1858638/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:185090/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:183751/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:1825065/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:182460/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:1786870/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:1783780/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:1605209/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:1762123/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:1755564/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:1749136/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:1727281/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:1707240/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:1702652/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:1688609/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:16804/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:1676920/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:1645795/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:1644680/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCAGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:383319/65‑1 (MQ=255)
cGCAGTGATTGACCCGTTCCTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:1267428/65‑1 (MQ=255)
 gCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:834592/64‑1 (MQ=255)
 gCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:1165938/64‑1 (MQ=255)
 gCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:1164560/64‑1 (MQ=255)
  cAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:1481199/63‑1 (MQ=255)
   aGTGATTGACCCGTTGTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTg  <  1:1798846/62‑1 (MQ=255)
                                                                |
CGCAGTGATTGACCCGTTCTTCGCCGACTCCACCCTGATTATCCGTTGCGACATCCTTGAACCTG  >  W3110S.gb/3578868‑3578932

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑