Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3581351	3581386	36	61 [0]	[0] 30	glnL	sensory kinase in two‑component regulatory system with GlnG

TTATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAG  >  W3110S.gb/3581287‑3581350                                                                | ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAGTTTACCAGTTGGCCAg  <  1:531168/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:705493/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:307059/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:324062/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:332567/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:334092/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:361368/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:409077/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:459452/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:461065/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:473867/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:528135/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:542076/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:650954/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:6619/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:677900/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:251371/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:709961/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:711796/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:716261/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:72119/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:732797/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:761428/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:788084/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:789065/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:79847/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:800570/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:841522/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:863783/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:928383/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:949612/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:222643/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:1050658/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:1078652/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:109171/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:1103297/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:1177988/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:1280715/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:1299437/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:1337051/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:1394495/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:1395470/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:1485894/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:1500311/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:1580665/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:1605268/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:1658563/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:1661561/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:1700161/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:1719705/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:1776466/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:1807347/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:1823479/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:1843658/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:1857775/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:194693/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:204686/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:218616/64‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:101981/64‑1 (MQ=255)  tATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:207419/63‑1 (MQ=255)   aTCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAg  <  1:1634680/62‑1 (MQ=255)                                                                | TTATCCATCGCTCGTAATTTGATTGATCAGCATTCAGGCAAAATTGAATTTACCAGTTGGCCAG  >  W3110S.gb/3581287‑3581350

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑