Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3581806	3581847	42	45 [0]	[0] 3	glnG	fused DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with GlnL, nitrogen regulator I (NRI)

GCTGGTTGAGCGCGCTATCAGTCATTACCAGGAACAGCAGCAGCCGCGTAATGTTCAGCTTAACG  >  W3110S.gb/3581741‑3581805                                                                 | gcTGGTTGAGCGCGCTATCAGTCATTACCAGGAACAGCAGCAGCCGCGTAATGTTCAGCTTAACg  <  1:793757/65‑1 (MQ=255) gcTGGTTGAGCGCGCTATCAGTCATTACCAGGAACAGCAGCAGCCGCGTAATGTTCAGCTTAACg  <  1:1029146/65‑1 (MQ=255) gcTGGTTGAGCGCGCTATCAGTCATTACCAGGAACAGCAGCAGCCGCGTAATGTTCAGCTTAACg  <  1:346746/65‑1 (MQ=255) gcTGGTTGAGCGCGCTATCAGTCATTACCAGGAACAGCAGCAGCCGCGTAATGTTCAGCTTAACg  <  1:477778/65‑1 (MQ=255) gcTGGTTGAGCGCGCTATCAGTCATTACCAGGAACAGCAGCAGCCGCGTAATGTTCAGCTTAACg  <  1:487288/65‑1 (MQ=255) gcTGGTTGAGCGCGCTATCAGTCATTACCAGGAACAGCAGCAGCCGCGTAATGTTCAGCTTAACg  <  1:52892/65‑1 (MQ=255) gcTGGTTGAGCGCGCTATCAGTCATTACCAGGAACAGCAGCAGCCGCGTAATGTTCAGCTTAACg  <  1:562776/65‑1 (MQ=255) gcTGGTTGAGCGCGCTATCAGTCATTACCAGGAACAGCAGCAGCCGCGTAATGTTCAGCTTAACg  <  1:577431/65‑1 (MQ=255) gcTGGTTGAGCGCGCTATCAGTCATTACCAGGAACAGCAGCAGCCGCGTAATGTTCAGCTTAACg  <  1:646885/65‑1 (MQ=255) gcTGGTTGAGCGCGCTATCAGTCATTACCAGGAACAGCAGCAGCCGCGTAATGTTCAGCTTAACg  <  1:701579/65‑1 (MQ=255) gcTGGTTGAGCGCGCTATCAGTCATTACCAGGAACAGCAGCAGCCGCGTAATGTTCAGCTTAACg  <  1:764656/65‑1 (MQ=255) gcTGGTTGAGCGCGCTATCAGTCATTACCAGGAACAGCAGCAGCCGCGTAATGTTCAGCTTAACg  <  1:33424/65‑1 (MQ=255) gcTGGTTGAGCGCGCTATCAGTCATTACCAGGAACAGCAGCAGCCGCGTAATGTTCAGCTTAACg  <  1:829176/65‑1 (MQ=255) gcTGGTTGAGCGCGCTATCAGTCATTACCAGGAACAGCAGCAGCCGCGTAATGTTCAGCTTAACg  <  1:836853/65‑1 (MQ=255) gcTGGTTGAGCGCGCTATCAGTCATTACCAGGAACAGCAGCAGCCGCGTAATGTTCAGCTTAACg  <  1:848533/65‑1 (MQ=255) gcTGGTTGAGCGCGCTATCAGTCATTACCAGGAACAGCAGCAGCCGCGTAATGTTCAGCTTAACg  <  1:87666/65‑1 (MQ=255) gcTGGTTGAGCGCGCTATCAGTCATTACCAGGAACAGCAGCAGCCGCGTAATGTTCAGCTTAACg  <  1:881091/65‑1 (MQ=255) gcTGGTTGAGCGCGCTATCAGTCATTACCAGGAACAGCAGCAGCCGCGTAATGTTCAGCTTAACg  <  1:945334/65‑1 (MQ=255) gcTGGTTGAGCGCGCTATCAGTCATTACCAGGAACAGCAGCAGCCGCGTAATGTTCAGCTTAACg  <  1:956526/65‑1 (MQ=255) gcTGGTTGAGCGCGCTATCAGTCATTACCAGGAACAGCAGCAGCCGCGTAATGTTCAGCTTAACg  <  1:969755/65‑1 (MQ=255) gcTGGTTGAGCGCGCTATCAGTCATTACCAGGAACAGCAGCAGCCGCGTAATGTTCAGCTTAACg  <  1:969847/65‑1 (MQ=255) gcTGGTTGAGCGCGCTATCAGTCATTACCAGGAACAGCAGCAGCCGCGTAATGTTCAGCTTAACg  <  1:977315/65‑1 (MQ=255) gcTGGTTGAGCGCGCTATCAGTCATTACCAGGAACAGCAGCAGCCGCGTAATGTTCAGCTTAACg  <  1:1367921/65‑1 (MQ=255) gcTGGTTGAGCGCGCTATCAGTCATTACCAGGAACAGCAGCAGCCGCGTAATGTTCAGCTTAACg  <  1:1109237/65‑1 (MQ=255) gcTGGTTGAGCGCGCTATCAGTCATTACCAGGAACAGCAGCAGCCGCGTAATGTTCAGCTTAACg  <  1:1118436/65‑1 (MQ=255) gcTGGTTGAGCGCGCTATCAGTCATTACCAGGAACAGCAGCAGCCGCGTAATGTTCAGCTTAACg  <  1:1125072/65‑1 (MQ=255) gcTGGTTGAGCGCGCTATCAGTCATTACCAGGAACAGCAGCAGCCGCGTAATGTTCAGCTTAACg  <  1:1153614/65‑1 (MQ=255) gcTGGTTGAGCGCGCTATCAGTCATTACCAGGAACAGCAGCAGCCGCGTAATGTTCAGCTTAACg  <  1:1156906/65‑1 (MQ=255) gcTGGTTGAGCGCGCTATCAGTCATTACCAGGAACAGCAGCAGCCGCGTAATGTTCAGCTTAACg  <  1:1190006/65‑1 (MQ=255) gcTGGTTGAGCGCGCTATCAGTCATTACCAGGAACAGCAGCAGCCGCGTAATGTTCAGCTTAACg  <  1:119965/65‑1 (MQ=255) gcTGGTTGAGCGCGCTATCAGTCATTACCAGGAACAGCAGCAGCCGCGTAATGTTCAGCTTAACg  <  1:1279837/65‑1 (MQ=255) gcTGGTTGAGCGCGCTATCAGTCATTACCAGGAACAGCAGCAGCCGCGTAATGTTCAGCTTAACg  <  1:1287061/65‑1 (MQ=255) gcTGGTTGAGCGCGCTATCAGTCATTACCAGGAACAGCAGCAGCCGCGTAATGTTCAGCTTAACg  <  1:1290400/65‑1 (MQ=255) gcTGGTTGAGCGCGCTATCAGTCATTACCAGGAACAGCAGCAGCCGCGTAATGTTCAGCTTAACg  <  1:1355325/65‑1 (MQ=255) gcTGGTTGAGCGCGCTATCAGTCATTACCAGGAACAGCAGCAGCCGCGTAATGTTCAGCTTAACg  <  1:228703/65‑1 (MQ=255) gcTGGTTGAGCGCGCTATCAGTCATTACCAGGAACAGCAGCAGCCGCGTAATGTTCAGCTTAACg  <  1:1468888/65‑1 (MQ=255) gcTGGTTGAGCGCGCTATCAGTCATTACCAGGAACAGCAGCAGCCGCGTAATGTTCAGCTTAACg  <  1:1660871/65‑1 (MQ=255) gcTGGTTGAGCGCGCTATCAGTCATTACCAGGAACAGCAGCAGCCGCGTAATGTTCAGCTTAACg  <  1:1735809/65‑1 (MQ=255) gcTGGTTGAGCGCGCTATCAGTCATTACCAGGAACAGCAGCAGCCGCGTAATGTTCAGCTTAACg  <  1:1737519/65‑1 (MQ=255) gcTGGTTGAGCGCGCTATCAGTCATTACCAGGAACAGCAGCAGCCGCGTAATGTTCAGCTTAACg  <  1:1822777/65‑1 (MQ=255) gcTGGTTGAGCGCGCTATCAGTCATTACCAGGAACAGCAGCAGCCGCGTAATGTTCAGCTTAACg  <  1:1878270/65‑1 (MQ=255)  cTGGTTGAGCGCGCTATCAGTCATTACCAGGAACAGCAGCAGCCGCGTAATGTTCAGCTTAACg  <  1:685140/64‑1 (MQ=255)  cTGGTTGAGCGCGCTATCAGTCATTACCAGGAACAGCAGCAGCCGCGTAATGTTCAGCTTAACg  <  1:1539284/64‑1 (MQ=255)  cTGGTTGAGCGCGCTATCAGTCATTACCAGGAACAGCAGCAGCCGCGTAATGTTCAGCTTAACg  <  1:358509/64‑1 (MQ=255)  cTGGTTGAGCGCGCTATCAGTCATTACCAGGAACAGCAGCAGCCGCGTAATGTTCAGCTTAACg  <  1:208335/64‑1 (MQ=255)                                                                 | GCTGGTTGAGCGCGCTATCAGTCATTACCAGGAACAGCAGCAGCCGCGTAATGTTCAGCTTAACG  >  W3110S.gb/3581741‑3581805

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑