Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3621290	3621334	45	33 [0]	[0] 19	[ysgA]	[ysgA]

CAACGCTGATTATCGCCCGAGCTATCATGCCGCATCTGCAGAAGATGGCTGGCAGCGTATGCTGG  >  W3110S.gb/3621225‑3621289                                                                 | cAACGCTGATTATCGCCCGAGCTATCATGCCGCATCTGCAGAAGATGGCTGGCAGCGTATGCTgg  >  1:414485/1‑65 (MQ=255) cAACGCTGATTATCGCCCGAGCTATCATGCCGCATCTGCAGAAGATGGCTGGCAGCGTATGCTgg  >  1:1750071/1‑65 (MQ=255) cAACGCTGATTATCGCCCGAGCTATCATGCCGCATCTGCAGAAGATGGCTGGCAGCGTATGCTgg  >  1:1764983/1‑65 (MQ=255) cAACGCTGATTATCGCCCGAGCTATCATGCCGCATCTGCAGAAGATGGCTGGCAGCGTATGCTgg  >  1:1810832/1‑65 (MQ=255) cAACGCTGATTATCGCCCGAGCTATCATGCCGCATCTGCAGAAGATGGCTGGCAGCGTATGCTgg  >  1:1860129/1‑65 (MQ=255) cAACGCTGATTATCGCCCGAGCTATCATGCCGCATCTGCAGAAGATGGCTGGCAGCGTATGCTgg  >  1:1876552/1‑65 (MQ=255) cAACGCTGATTATCGCCCGAGCTATCATGCCGCATCTGCAGAAGATGGCTGGCAGCGTATGCTgg  >  1:1882134/1‑65 (MQ=255) cAACGCTGATTATCGCCCGAGCTATCATGCCGCATCTGCAGAAGATGGCTGGCAGCGTATGCTgg  >  1:229309/1‑65 (MQ=255) cAACGCTGATTATCGCCCGAGCTATCATGCCGCATCTGCAGAAGATGGCTGGCAGCGTATGCTgg  >  1:317090/1‑65 (MQ=255) cAACGCTGATTATCGCCCGAGCTATCATGCCGCATCTGCAGAAGATGGCTGGCAGCGTATGCTgg  >  1:1701855/1‑65 (MQ=255) cAACGCTGATTATCGCCCGAGCTATCATGCCGCATCTGCAGAAGATGGCTGGCAGCGTATGCTgg  >  1:497547/1‑65 (MQ=255) cAACGCTGATTATCGCCCGAGCTATCATGCCGCATCTGCAGAAGATGGCTGGCAGCGTATGCTgg  >  1:568528/1‑65 (MQ=255) cAACGCTGATTATCGCCCGAGCTATCATGCCGCATCTGCAGAAGATGGCTGGCAGCGTATGCTgg  >  1:580313/1‑65 (MQ=255) cAACGCTGATTATCGCCCGAGCTATCATGCCGCATCTGCAGAAGATGGCTGGCAGCGTATGCTgg  >  1:635177/1‑65 (MQ=255) cAACGCTGATTATCGCCCGAGCTATCATGCCGCATCTGCAGAAGATGGCTGGCAGCGTATGCTgg  >  1:700348/1‑65 (MQ=255) cAACGCTGATTATCGCCCGAGCTATCATGCCGCATCTGCAGAAGATGGCTGGCAGCGTATGCTgg  >  1:750751/1‑65 (MQ=255) cAACGCTGATTATCGCCCGAGCTATCATGCCGCATCTGCAGAAGATGGCTGGCAGCGTATGCTgg  >  1:849705/1‑65 (MQ=255) cAACGCTGATTATCGCCCGAGCTATCATGCCGCATCTGCAGAAGATGGCTGGCAGCGTATGCTgg  >  1:1015638/1‑65 (MQ=255) cAACGCTGATTATCGCCCGAGCTATCATGCCGCATCTGCAGAAGATGGCTGGCAGCGTATGCTgg  >  1:1511916/1‑65 (MQ=255) cAACGCTGATTATCGCCCGAGCTATCATGCCGCATCTGCAGAAGATGGCTGGCAGCGTATGCTgg  >  1:1505438/1‑65 (MQ=255) cAACGCTGATTATCGCCCGAGCTATCATGCCGCATCTGCAGAAGATGGCTGGCAGCGTATGCTgg  >  1:1468431/1‑65 (MQ=255) cAACGCTGATTATCGCCCGAGCTATCATGCCGCATCTGCAGAAGATGGCTGGCAGCGTATGCTgg  >  1:1395921/1‑65 (MQ=255) cAACGCTGATTATCGCCCGAGCTATCATGCCGCATCTGCAGAAGATGGCTGGCAGCGTATGCTgg  >  1:1387460/1‑65 (MQ=255) cAACGCTGATTATCGCCCGAGCTATCATGCCGCATCTGCAGAAGATGGCTGGCAGCGTATGCTgg  >  1:136560/1‑65 (MQ=255) cAACGCTGATTATCGCCCGAGCTATCATGCCGCATCTGCAGAAGATGGCTGGCAGCGTATGCTgg  >  1:1350640/1‑65 (MQ=255) cAACGCTGATTATCGCCCGAGCTATCATGCCGCATCTGCAGAAGATGGCTGGCAGCGTATGCTgg  >  1:1297838/1‑65 (MQ=255) cAACGCTGATTATCGCCCGAGCTATCATGCCGCATCTGCAGAAGATGGCTGGCAGCGTATGCTgg  >  1:1216525/1‑65 (MQ=255) cAACGCTGATTATCGCCCGAGCTATCATGCCGCATCTGCAGAAGATGGCTGGCAGCGTATGCTgg  >  1:116892/1‑65 (MQ=255) cAACGCTGATTATCGCCCGAGCTATCATGCCGCATCTGCAGAAGATGGCTGGCAGCGTATGCTgg  >  1:1160207/1‑65 (MQ=255) cAACGCTGATTATCGCCCGAGCTATCATGCCGCATCTGCAGAAGATGGCTGGCAGCGTATGCTgg  >  1:111688/1‑65 (MQ=255) cAACGCTGATTATCGCCCGAGCTATCATGCCGCATCTGCAGAAGATGGCTGGCAGCGTATGCTgg  >  1:1088868/1‑65 (MQ=255) cAACGCTGATTATCGCCCGAGCTATCATGCCGCATCTGCAGAAGATGGCTGGCAGCGTATGCTgg  >  1:1049730/1‑65 (MQ=255) cAACGCTGATTATCGCCCGAGCTATCATGCCGCATCTGCAGAAGATGGCTGGCAGCGTATGCTgg  >  1:1017233/1‑65 (MQ=255)                                                                 | CAACGCTGATTATCGCCCGAGCTATCATGCCGCATCTGCAGAAGATGGCTGGCAGCGTATGCTGG  >  W3110S.gb/3621225‑3621289

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑