Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3631217	3631271	55	85 [0]	[1] 67	pldA	outer membrane phospholipase A

AGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGT  >  W3110S.gb/3631152‑3631216                                                                 | aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTTTCGTCAGt  >  1:833443/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:34195/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:550433/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:537301/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:513300/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:502870/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:487000/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:475038/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:471273/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:467263/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:453833/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:395375/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:558798/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:33135/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:303859/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:293748/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:285191/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:264248/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:24200/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:198103/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:1977/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:1007225/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:739785/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:968678/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:965089/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:953004/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:951803/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:938370/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:911693/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:896198/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:893451/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:812362/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:191027/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:718401/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:700257/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:685901/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:668984/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:622975/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:619318/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:600866/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:586697/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:586534/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:1155725/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:1380733/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:1281612/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:1268089/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:1259566/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:1232323/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:1209224/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:1195930/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:1195539/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:1181395/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:1169541/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:1388728/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:114439/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:1107571/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:1102461/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:1076480/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:1071905/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:1042623/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:1031604/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:1030587/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:1018745/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:1676577/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:1841492/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:183754/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:1823794/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:1822232/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:1756145/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:174451/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:171185/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:1703951/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:1870999/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:1657491/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:1628814/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:1593790/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:1580654/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:1556718/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:1506634/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:1489223/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:1478675/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:140675/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATACGGGTTATCGTCAGt  >  1:444255/1‑65 (MQ=255) aGGTGATAGACGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:855777/1‑65 (MQ=255) aGGTGAGAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGt  >  1:1702401/1‑65 (MQ=255)                                                                 | AGGTGATAGCCGATTTTAAGCTGGTAGTAACCCATATATTTGGTGATATCCGGGTTATCGTCAGT  >  W3110S.gb/3631152‑3631216

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑