Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	331489	331514	26	45 [0]	[0] 12	betT/yahA	choline transporter of high affinity/predicted DNA‑binding transcriptional regulator

ACTGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGAT  >  W3110S.gb/331432‑331488                                                         | agtGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGTAt  <  1:232184/55‑1 (MQ=255) aCTGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGAt  <  1:682976/57‑1 (MQ=255) aCTGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGAt  <  1:271900/57‑1 (MQ=255) aCTGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGAt  <  1:273326/57‑1 (MQ=255) aCTGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGAt  <  1:385388/57‑1 (MQ=255) aCTGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGAt  <  1:40750/57‑1 (MQ=255) aCTGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGAt  <  1:41108/57‑1 (MQ=255) aCTGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGAt  <  1:419358/57‑1 (MQ=255) aCTGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGAt  <  1:452211/57‑1 (MQ=255) aCTGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGAt  <  1:554481/57‑1 (MQ=255) aCTGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGAt  <  1:601367/57‑1 (MQ=255) aCTGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGAt  <  1:970237/57‑1 (MQ=255) aCTGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGAt  <  1:721762/57‑1 (MQ=255) aCTGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGAt  <  1:751054/57‑1 (MQ=255) aCTGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGAt  <  1:758877/57‑1 (MQ=255) aCTGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGAt  <  1:776033/57‑1 (MQ=255) aCTGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGAt  <  1:793599/57‑1 (MQ=255) aCTGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGAt  <  1:859404/57‑1 (MQ=255) aCTGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGAt  <  1:872176/57‑1 (MQ=255) aCTGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGAt  <  1:919399/57‑1 (MQ=255) aCTGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGAt  <  1:937715/57‑1 (MQ=255) aCTGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGAt  <  1:1018020/57‑1 (MQ=255) aCTGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGAt  <  1:1857676/57‑1 (MQ=255) aCTGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGAt  <  1:1064443/57‑1 (MQ=255) aCTGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGAt  <  1:1074481/57‑1 (MQ=255) aCTGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGAt  <  1:1081624/57‑1 (MQ=255) aCTGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGAt  <  1:1089178/57‑1 (MQ=255) aCTGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGAt  <  1:1137449/57‑1 (MQ=255) aCTGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGAt  <  1:1224720/57‑1 (MQ=255) aCTGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGAt  <  1:1240552/57‑1 (MQ=255) aCTGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGAt  <  1:138709/57‑1 (MQ=255) aCTGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGAt  <  1:1401017/57‑1 (MQ=255) aCTGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGAt  <  1:1431418/57‑1 (MQ=255) aCTGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGAt  <  1:15071/57‑1 (MQ=255) aCTGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGAt  <  1:1532197/57‑1 (MQ=255) aCTGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGAt  <  1:160121/57‑1 (MQ=255) aCTGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGAt  <  1:1627186/57‑1 (MQ=255) aCTGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGAt  <  1:1660659/57‑1 (MQ=255) aCTGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGAt  <  1:1680391/57‑1 (MQ=255) aCTGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGAt  <  1:1712972/57‑1 (MQ=255) aCTGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGAt  <  1:1757024/57‑1 (MQ=255) aCTGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGAt  <  1:188193/57‑1 (MQ=255)  cTGTTTTTGATCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGAt  <  1:94780/56‑1 (MQ=255)       tttGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGAt  <  1:684150/51‑1 (MQ=255)                  aTCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGAt  <  1:1571003/40‑1 (MQ=255)                                                         | ACTGTTTTTGAGCGAGCATCAGAGGTAAAGATAATCTTCTTGATAGTGATGTGGGAT  >  W3110S.gb/331432‑331488

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑