Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3697204	3697257	54	40 [0]	[0] 42	hsrA	predicted multidrug or homocysteine efflux system

CTGATCTTGCCGTTGTTTATATTAGGGATGGCTATGTCGACGCAGTTTACCGCGATGAATACCAT  >  W3110S.gb/3697139‑3697203                                                                 | ctcaTCTTGCCGTTGTTTATATTAGGGATGGCTATGTCGACGCAGTTTACCGCGATGAATACCAt  >  1:243165/4‑65 (MQ=255) cTGATCTTGCCGTTGTTTATATTAGGGATGGCTATGTCGACGCAGTTTACCGCGATGAATACCAt  >  1:630375/1‑65 (MQ=255) cTGATCTTGCCGTTGTTTATATTAGGGATGGCTATGTCGACGCAGTTTACCGCGATGAATACCAt  >  1:195982/1‑65 (MQ=255) cTGATCTTGCCGTTGTTTATATTAGGGATGGCTATGTCGACGCAGTTTACCGCGATGAATACCAt  >  1:258427/1‑65 (MQ=255) cTGATCTTGCCGTTGTTTATATTAGGGATGGCTATGTCGACGCAGTTTACCGCGATGAATACCAt  >  1:280840/1‑65 (MQ=255) cTGATCTTGCCGTTGTTTATATTAGGGATGGCTATGTCGACGCAGTTTACCGCGATGAATACCAt  >  1:337272/1‑65 (MQ=255) cTGATCTTGCCGTTGTTTATATTAGGGATGGCTATGTCGACGCAGTTTACCGCGATGAATACCAt  >  1:34039/1‑65 (MQ=255) cTGATCTTGCCGTTGTTTATATTAGGGATGGCTATGTCGACGCAGTTTACCGCGATGAATACCAt  >  1:472174/1‑65 (MQ=255) cTGATCTTGCCGTTGTTTATATTAGGGATGGCTATGTCGACGCAGTTTACCGCGATGAATACCAt  >  1:583106/1‑65 (MQ=255) cTGATCTTGCCGTTGTTTATATTAGGGATGGCTATGTCGACGCAGTTTACCGCGATGAATACCAt  >  1:610792/1‑65 (MQ=255) cTGATCTTGCCGTTGTTTATATTAGGGATGGCTATGTCGACGCAGTTTACCGCGATGAATACCAt  >  1:1025384/1‑65 (MQ=255) cTGATCTTGCCGTTGTTTATATTAGGGATGGCTATGTCGACGCAGTTTACCGCGATGAATACCAt  >  1:66533/1‑65 (MQ=255) cTGATCTTGCCGTTGTTTATATTAGGGATGGCTATGTCGACGCAGTTTACCGCGATGAATACCAt  >  1:668125/1‑65 (MQ=255) cTGATCTTGCCGTTGTTTATATTAGGGATGGCTATGTCGACGCAGTTTACCGCGATGAATACCAt  >  1:670298/1‑65 (MQ=255) cTGATCTTGCCGTTGTTTATATTAGGGATGGCTATGTCGACGCAGTTTACCGCGATGAATACCAt  >  1:704064/1‑65 (MQ=255) cTGATCTTGCCGTTGTTTATATTAGGGATGGCTATGTCGACGCAGTTTACCGCGATGAATACCAt  >  1:706799/1‑65 (MQ=255) cTGATCTTGCCGTTGTTTATATTAGGGATGGCTATGTCGACGCAGTTTACCGCGATGAATACCAt  >  1:753155/1‑65 (MQ=255) cTGATCTTGCCGTTGTTTATATTAGGGATGGCTATGTCGACGCAGTTTACCGCGATGAATACCAt  >  1:879958/1‑65 (MQ=255) cTGATCTTGCCGTTGTTTATATTAGGGATGGCTATGTCGACGCAGTTTACCGCGATGAATACCAt  >  1:940617/1‑65 (MQ=255) cTGATCTTGCCGTTGTTTATATTAGGGATGGCTATGTCGACGCAGTTTACCGCGATGAATACCAt  >  1:984921/1‑65 (MQ=255) cTGATCTTGCCGTTGTTTATATTAGGGATGGCTATGTCGACGCAGTTTACCGCGATGAATACCAt  >  1:1453922/1‑65 (MQ=255) cTGATCTTGCCGTTGTTTATATTAGGGATGGCTATGTCGACGCAGTTTACCGCGATGAATACCAt  >  1:1020450/1‑65 (MQ=255) cTGATCTTGCCGTTGTTTATATTAGGGATGGCTATGTCGACGCAGTTTACCGCGATGAATACCAt  >  1:1096685/1‑65 (MQ=255) cTGATCTTGCCGTTGTTTATATTAGGGATGGCTATGTCGACGCAGTTTACCGCGATGAATACCAt  >  1:1155171/1‑65 (MQ=255) cTGATCTTGCCGTTGTTTATATTAGGGATGGCTATGTCGACGCAGTTTACCGCGATGAATACCAt  >  1:12172/1‑65 (MQ=255) cTGATCTTGCCGTTGTTTATATTAGGGATGGCTATGTCGACGCAGTTTACCGCGATGAATACCAt  >  1:1287279/1‑65 (MQ=255) cTGATCTTGCCGTTGTTTATATTAGGGATGGCTATGTCGACGCAGTTTACCGCGATGAATACCAt  >  1:1292959/1‑65 (MQ=255) cTGATCTTGCCGTTGTTTATATTAGGGATGGCTATGTCGACGCAGTTTACCGCGATGAATACCAt  >  1:1305543/1‑65 (MQ=255) cTGATCTTGCCGTTGTTTATATTAGGGATGGCTATGTCGACGCAGTTTACCGCGATGAATACCAt  >  1:1358857/1‑65 (MQ=255) cTGATCTTGCCGTTGTTTATATTAGGGATGGCTATGTCGACGCAGTTTACCGCGATGAATACCAt  >  1:14455/1‑65 (MQ=255) cTGATCTTGCCGTTGTTTATATTAGGGATGGCTATGTCGACGCAGTTTACCGCGATGAATACCAt  >  1:1547320/1‑65 (MQ=255) cTGATCTTGCCGTTGTTTATATTAGGGATGGCTATGTCGACGCAGTTTACCGCGATGAATACCAt  >  1:1573004/1‑65 (MQ=255) cTGATCTTGCCGTTGTTTATATTAGGGATGGCTATGTCGACGCAGTTTACCGCGATGAATACCAt  >  1:1606464/1‑65 (MQ=255) cTGATCTTGCCGTTGTTTATATTAGGGATGGCTATGTCGACGCAGTTTACCGCGATGAATACCAt  >  1:1634081/1‑65 (MQ=255) cTGATCTTGCCGTTGTTTATATTAGGGATGGCTATGTCGACGCAGTTTACCGCGATGAATACCAt  >  1:1656227/1‑65 (MQ=255) cTGATCTTGCCGTTGTTTATATTAGGGATGGCTATGTCGACGCAGTTTACCGCGATGAATACCAt  >  1:1720777/1‑65 (MQ=255) cTGATCTTGCCGTTGTTTATATTAGGGATGGCTATGTCGACGCAGTTTACCGCGATGAATACCAt  >  1:1804579/1‑65 (MQ=255) cTGATCTTGCCGTTGTTTATATTAGGGATGGCTATGTCGACGCAGTTTACCGCGATGAATACCAt  >  1:1850057/1‑65 (MQ=255) cTGATCTTGCCGTTGTTTATATTAGGGATGGCTATGTCGACGCAGTTTACCGCGATGAATACCAt  >  1:1871481/1‑65 (MQ=255) cTGATCTTGCCGTTGTTTATATTAGGGATGGCTATGTCGACGCAGATTACCGCGATGAATACCAt  >  1:1871637/1‑65 (MQ=255)                                                                 | CTGATCTTGCCGTTGTTTATATTAGGGATGGCTATGTCGACGCAGTTTACCGCGATGAATACCAT  >  W3110S.gb/3697139‑3697203

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑