Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3720267	3720374	108	84 [0]	[0] 132	atpD	F1 sector of membrane‑bound ATP synthase, beta subunit

TACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGT  >  W3110S.gb/3720203‑3720266                                                                | tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:391229/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:583184/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:526945/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  >  1:526472/1‑64 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  >  1:52527/1‑64 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:513320/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:475152/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:465749/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:432196/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:423938/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:397427/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:607426/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:379211/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:347096/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:346738/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:334067/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:322142/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:305188/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:259993/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:101118/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:212709/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  >  1:718958/1‑64 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:991571/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:946057/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  >  1:936699/1‑64 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:926664/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:922929/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:90228/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:898301/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  >  1:830302/1‑64 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:793767/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  >  1:235435/1‑64 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:710502/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:709600/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:690337/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:679601/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:664176/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:640688/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  >  1:6299/1‑64 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:61606/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:615548/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:1130255/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:135063/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:1308527/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:1305028/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  >  1:1260180/1‑64 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:1237634/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:1212147/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:1185327/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:1169665/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:116068/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  >  1:1808249/1‑64 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:1124030/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:1082639/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:1081860/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  >  1:1080490/1‑64 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:1077460/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  >  1:1076236/1‑64 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:1070586/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  >  1:1049449/1‑64 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:1030914/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:1388427/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:211574/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:1797961/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:1760725/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  >  1:1757642/1‑64 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:174570/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:1745666/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:1687420/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:1669223/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:1668598/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:16574/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:1594298/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:1568850/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:1548023/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  >  1:1544640/1‑64 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:1539214/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:1439099/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:142981/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:1383001/64‑1 (MQ=255) tACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGAAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:1024265/64‑1 (MQ=255)             acttgactGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:971344/52‑1 (MQ=255)                        ccGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:877326/41‑1 (MQ=255)                         cGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGt  <  1:286169/40‑1 (MQ=255)                                                                | TACCTGCGGATGACTTGACTGACCCGTCTCCGGCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGT  >  W3110S.gb/3720203‑3720266

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑