Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	334790	334992	203	56 [0]	[0] 55	yahD	predicted transcriptional regulator with ankyrin domain

TCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAC  >  W3110S.gb/334725‑334789                                                                 | tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:696171/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:1767028/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:1853814/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:1855584/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:1858877/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:222163/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:39226/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:471284/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:545495/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:565085/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:582745/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:627173/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:66271/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:66683/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:1710409/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:700344/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:713737/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:766489/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:770533/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:804260/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:810235/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:826148/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:846676/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:86378/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:875622/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:906477/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:912323/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:988336/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:1488898/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:1104012/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:1124889/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:1138577/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:1227096/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:1346898/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:1410593/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:1412325/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:1428559/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:1433659/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:1439641/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:1441014/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:1446104/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:1465703/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:1101597/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:1529401/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:1549624/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:1560113/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:1582662/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:1611042/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:1616419/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:1630772/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:1643815/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:1651335/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:1679479/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:1688968/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:1706161/1‑65 (MQ=255) tCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAc  >  1:1707138/1‑65 (MQ=255)                                                                 | TCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAAC  >  W3110S.gb/334725‑334789

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑