Missing coverage evidence...
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GCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGACGCTGCTGCGTACCTTCAACAAAATGTTTGA  >  W3110S.gb/3728434‑3728498                                                                 | gCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGACGCTGCTGCGTACCTTCAACAAAATGTTTGa  >  1:1837193/1‑65 (MQ=255) gCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGACGCTGCTGCGTACCTTCAACAAAATGTTTGa  >  1:984660/1‑65 (MQ=255) gCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGACGCTGCTGCGTACCTTCAACAAAATGTTTGa  >  1:96117/1‑65 (MQ=255) gCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGACGCTGCTGCGTACCTTCAACAAAATGTTTGa  >  1:858579/1‑65 (MQ=255) gCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGACGCTGCTGCGTACCTTCAACAAAATGTTTGa  >  1:709367/1‑65 (MQ=255) gCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGACGCTGCTGCGTACCTTCAACAAAATGTTTGa  >  1:686272/1‑65 (MQ=255) gCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGACGCTGCTGCGTACCTTCAACAAAATGTTTGa  >  1:680503/1‑65 (MQ=255) gCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGACGCTGCTGCGTACCTTCAACAAAATGTTTGa  >  1:613535/1‑65 (MQ=255) gCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGACGCTGCTGCGTACCTTCAACAAAATGTTTGa  >  1:566646/1‑65 (MQ=255) gCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGACGCTGCTGCGTACCTTCAACAAAATGTTTGa  >  1:512907/1‑65 (MQ=255) gCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGACGCTGCTGCGTACCTTCAACAAAATGTTTGa  >  1:462692/1‑65 (MQ=255) gCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGACGCTGCTGCGTACCTTCAACAAAATGTTTGa  >  1:340217/1‑65 (MQ=255) gCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGACGCTGCTGCGTACCTTCAACAAAATGTTTGa  >  1:240087/1‑65 (MQ=255) gCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGACGCTGCTGCGTACCTTCAACAAAATGTTTGa  >  1:236755/1‑65 (MQ=255) gCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGACGCTGCTGCGTACCTTCAACAAAATGTTTGa  >  1:190526/1‑65 (MQ=255) gCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGACGCTGCTGCGTACCTTCAACAAAATGTTTGa  >  1:1224804/1‑65 (MQ=255) gCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGACGCTGCTGCGTACCTTCAACAAAATGTTTGa  >  1:1827764/1‑65 (MQ=255) gCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGACGCTGCTGCGTACCTTCAACAAAATGTTTGa  >  1:1819346/1‑65 (MQ=255) gCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGACGCTGCTGCGTACCTTCAACAAAATGTTTGa  >  1:180354/1‑65 (MQ=255) gCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGACGCTGCTGCGTACCTTCAACAAAATGTTTGa  >  1:1715843/1‑65 (MQ=255) gCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGACGCTGCTGCGTACCTTCAACAAAATGTTTGa  >  1:1704716/1‑65 (MQ=255) gCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGACGCTGCTGCGTACCTTCAACAAAATGTTTGa  >  1:1659455/1‑65 (MQ=255) gCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGACGCTGCTGCGTACCTTCAACAAAATGTTTGa  >  1:155999/1‑65 (MQ=255) gCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGACGCTGCTGCGTACCTTCAACAAAATGTTTGa  >  1:1519109/1‑65 (MQ=255) gCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGACGCTGCTGCGTACCTTCAACAAAATGTTTGa  >  1:1475385/1‑65 (MQ=255) gCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGACGCTGCTGCGTACCTTCAACAAAATGTTTGa  >  1:1444134/1‑65 (MQ=255) gCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGACGCTGCTGCGTACCTTCAACAAAATGTTTGa  >  1:1328691/1‑65 (MQ=255) gCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGACGCTGCTGCGTACCTTCAACAAAATGTTTGa  >  1:1248362/1‑65 (MQ=255) gCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGACGCTGCTGCGTACCTTCAACAAAATGTTTGa  >  1:1236488/1‑65 (MQ=255)                                                                 | GCGTTTATCGGGCCGTCCGGCTGCGGTAAATCGACGCTGCTGCGTACCTTCAACAAAATGTTTGA  >  W3110S.gb/3728434‑3728498

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑