Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3789913	3789995	83	96 [0]	[0] 50	uhpA	DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system wtih UhpB

CGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGCG  >  W3110S.gb/3789849‑3789912                                                                | cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1824430/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:346111/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:322655/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:321047/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:277567/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:275389/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:261599/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:25365/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:246184/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:21908/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:213662/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1866699/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:369063/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1823026/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1804876/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1790716/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1781956/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1775246/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1761999/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1758474/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1740758/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1739310/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1721415/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1001228/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:689511/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:981688/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:968780/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:927193/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:876994/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:842843/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:789706/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:787240/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:763263/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:747509/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:747492/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:702218/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1703252/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:602127/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:598431/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:579832/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:519310/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:519057/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:517842/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:437262/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:431596/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:429674/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:414130/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:373474/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1163770/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1303597/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1302080/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1277162/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1267541/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1221435/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1212850/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1206239/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1190428/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1179491/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:117742/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1171227/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1324664/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1161365/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1131378/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1130371/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1114208/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:110020/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1074307/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1041662/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1039296/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1039169/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:102369/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1003083/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1520781/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1672238/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1667412/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1661933/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1622744/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1585973/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:15721/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1562067/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1559920/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1523344/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1523179/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1690714/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1484024/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1481926/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1448405/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1447125/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1423818/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1410358/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:135531/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1355000/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1351688/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1347448/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:1341275/1‑64 (MQ=255) cGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCCGCCGAAAGGTATGGcg  >  1:176960/1‑64 (MQ=255)                                                                | CGATATCTCCATGCCCGATATCTCCGGTCTGGAGCTGCTAAGCCAGCTGCCGAAAGGTATGGCG  >  W3110S.gb/3789849‑3789912

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑