Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3811691	3811701	11	46 [0]	[0] 66	yicE/gltS	predicted transporter/glutamate transporter

TCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGAAGT  >  W3110S.gb/3811627‑3811690                                                                | tCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGAAGt  <  1:635175/64‑1 (MQ=255) tCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGAAGt  <  1:1664669/64‑1 (MQ=255) tCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGAAGt  <  1:1724720/64‑1 (MQ=255) tCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGAAGt  <  1:1773718/64‑1 (MQ=255) tCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGAAGt  <  1:1830845/64‑1 (MQ=255) tCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGAAGt  <  1:184148/64‑1 (MQ=255) tCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGAAGt  <  1:31328/64‑1 (MQ=255) tCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGAAGt  <  1:319732/64‑1 (MQ=255) tCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGAAGt  <  1:33352/64‑1 (MQ=255) tCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGAAGt  <  1:373261/64‑1 (MQ=255) tCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGAAGt  <  1:413631/64‑1 (MQ=255) tCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGAAGt  <  1:524116/64‑1 (MQ=255) tCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGAAGt  <  1:1636250/64‑1 (MQ=255) tCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGAAGt  <  1:643209/64‑1 (MQ=255) tCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGAAGt  <  1:686534/64‑1 (MQ=255) tCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGAAGt  <  1:707282/64‑1 (MQ=255) tCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGAAGt  <  1:733547/64‑1 (MQ=255) tCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGAAGt  <  1:818423/64‑1 (MQ=255) tCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGAAGt  <  1:860854/64‑1 (MQ=255) tCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGAAGt  <  1:883007/64‑1 (MQ=255) tCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGAAGt  <  1:905818/64‑1 (MQ=255) tCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGAAGt  <  1:934351/64‑1 (MQ=255) tCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGAAGt  <  1:957486/64‑1 (MQ=255) tCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGAAGt  <  1:1206301/64‑1 (MQ=255) tCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGAAGt  <  1:1034549/64‑1 (MQ=255) tCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGAAGt  <  1:1036182/64‑1 (MQ=255) tCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGAAGt  <  1:1041032/64‑1 (MQ=255) tCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGAAGt  <  1:1048170/64‑1 (MQ=255) tCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGAAGt  <  1:1061325/64‑1 (MQ=255) tCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGAAGt  <  1:1081851/64‑1 (MQ=255) tCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGAAGt  <  1:1082635/64‑1 (MQ=255) tCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGAAGt  <  1:1162297/64‑1 (MQ=255) tCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGAAGt  <  1:1198749/64‑1 (MQ=255) tCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGAAGt  <  1:1023095/64‑1 (MQ=255) tCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGAAGt  <  1:1207434/64‑1 (MQ=255) tCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGAAGt  <  1:1237908/64‑1 (MQ=255) tCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGAAGt  <  1:1254711/64‑1 (MQ=255) tCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGAAGt  <  1:1325159/64‑1 (MQ=255) tCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGAAGt  <  1:1379299/64‑1 (MQ=255) tCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGAAGt  <  1:1415152/64‑1 (MQ=255) tCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGAAGt  <  1:142572/64‑1 (MQ=255) tCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGAAGt  <  1:1465858/64‑1 (MQ=255) tCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGAAGt  <  1:1511885/64‑1 (MQ=255) tCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGAAGt  <  1:161118/64‑1 (MQ=255)  cATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGAAGt  <  1:1119988/63‑1 (MQ=255)   aTTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGCTACCCGTCATAGTTCATGAAGt  <  1:1117841/62‑1 (MQ=255)                                                                | TCATTAACAGCTGAGAATTTGACCCAGGAAAGCATAACTCGATACCCGTCATAGTTCATGAAGT  >  W3110S.gb/3811627‑3811690

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑