Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3835713	3836048	336	95 [0]	[0] 8	rfaS	lipopolysaccharide core biosynthesis protein

TATGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCTA  >  W3110S.gb/3835649‑3835712                                                                | tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGTAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:960607/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:318513/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:50441/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:483116/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:476512/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:449434/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:443495/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:424572/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:409101/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:394555/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:384911/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:365466/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:354711/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:34597/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:515638/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:310666/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:28470/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:257805/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:24672/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:214820/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:206723/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:1883232/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:187866/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:1862539/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:1847383/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:7504/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:982328/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:977529/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:974270/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:969398/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:909472/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:894652/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:867837/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:818959/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:818186/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:808241/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:789166/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:1810361/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:722834/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:700112/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:687117/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:651954/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:63033/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:602488/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:590556/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:586046/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:58336/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:571416/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:1216485/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:146115/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:1453506/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:1437441/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:1410692/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:1345961/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:1345861/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:1343399/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:1305662/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:1300954/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:1261815/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:1240399/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:1470245/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:119886/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:1188495/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:1184045/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:1181473/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:1142197/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:1130590/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:1105717/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:1104916/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:1058173/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:1035018/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:1007678/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:1604062/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:1808662/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:1799516/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:1785580/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:1783380/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:1758804/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:1758075/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:1756181/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:1714335/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:1663843/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:1651919/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:1636546/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:1005713/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:1591051/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:1562982/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:1557116/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:1548226/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:1540497/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:1528412/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:1528248/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:1526621/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:152565/64‑1 (MQ=255) tatGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCta  <  1:1524568/64‑1 (MQ=255)                                                                | TATGATTTTGAGCATAGATTTATAGGGAATGAAAAGATCAAGGCAATAGAACAATTTTTTCCTA  >  W3110S.gb/3835649‑3835712

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑