Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3838105	3838112	8	81 [0]	[1] 137	rfaI	UDP‑D‑galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide‑ alpha‑1,3‑D‑galactosyltransferase

TGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACT  >  W3110S.gb/3838041‑3838104                                                                | tGGCTGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:1681676/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATTAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:1599869/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:536610/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:549717/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:518486/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:481005/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:47648/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:416990/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:399888/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:393997/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:267378/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:252935/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:220967/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:195399/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:1868129/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:1862276/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:1805435/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:1804849/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:179735/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:1792404/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:1778728/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:780230/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:999291/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:973233/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:906432/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:889073/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:888966/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:876762/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:861458/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:848757/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:836461/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:828373/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:173363/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:765374/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:756045/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:698280/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:68102/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:656922/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:643434/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:610469/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:603374/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:591263/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:125923/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:1354799/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:1342819/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:1309207/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:1305616/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:1301869/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:1301256/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:1297313/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:1285186/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:1277496/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:1383985/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:1205763/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:1189179/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:1175459/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:1145151/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:1132717/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:1099105/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:1083882/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:1081110/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:1002899/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:1523858/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:1001232/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:1731217/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:1711573/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:1696851/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:1659351/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:1654080/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:1649743/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:1533314/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:1741788/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:1491930/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:1474370/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:1474136/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:1438043/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:1411972/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:1410773/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:1390203/64‑1 (MQ=255) tGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:1386135/64‑1 (MQ=255) tGGCGAATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACt  <  1:1556719/64‑1 (MQ=255)                                                                | TGGCGGATAAACTTATTTTCGCTGATATTAAATATAACACCCAGTTCAGCTTAAATTATCAACT  >  W3110S.gb/3838041‑3838104

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑