Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3838982	3838982	1	21 [0]	[0] 17	rfaJ	UDP‑D‑glucose:(galactosyl)lipopolysaccharide glucosyltransferase

CAGGTTGTCTGATCCTGAATTACTTGGGCAGTACTTTAATTCCGGTGTCGTTTATTTAGACTTA  >  W3110S.gb/3838918‑3838981                                                                | cAGGTTGTCTGATCCTGAATTACTTGGGCAGTACTTTAATTCCGGTGTCGTTTATTTAGACTTa  <  1:203437/64‑1 (MQ=255) cAGGTTGTCTGATCCTGAATTACTTGGGCAGTACTTTAATTCCGGTGTCGTTTATTTAGACTTa  <  1:988759/64‑1 (MQ=255) cAGGTTGTCTGATCCTGAATTACTTGGGCAGTACTTTAATTCCGGTGTCGTTTATTTAGACTTa  <  1:740448/64‑1 (MQ=255) cAGGTTGTCTGATCCTGAATTACTTGGGCAGTACTTTAATTCCGGTGTCGTTTATTTAGACTTa  <  1:72996/64‑1 (MQ=255) cAGGTTGTCTGATCCTGAATTACTTGGGCAGTACTTTAATTCCGGTGTCGTTTATTTAGACTTa  <  1:646645/64‑1 (MQ=255) cAGGTTGTCTGATCCTGAATTACTTGGGCAGTACTTTAATTCCGGTGTCGTTTATTTAGACTTa  <  1:629531/64‑1 (MQ=255) cAGGTTGTCTGATCCTGAATTACTTGGGCAGTACTTTAATTCCGGTGTCGTTTATTTAGACTTa  <  1:625682/64‑1 (MQ=255) cAGGTTGTCTGATCCTGAATTACTTGGGCAGTACTTTAATTCCGGTGTCGTTTATTTAGACTTa  <  1:429239/64‑1 (MQ=255) cAGGTTGTCTGATCCTGAATTACTTGGGCAGTACTTTAATTCCGGTGTCGTTTATTTAGACTTa  <  1:31840/64‑1 (MQ=255) cAGGTTGTCTGATCCTGAATTACTTGGGCAGTACTTTAATTCCGGTGTCGTTTATTTAGACTTa  <  1:1012925/64‑1 (MQ=255) cAGGTTGTCTGATCCTGAATTACTTGGGCAGTACTTTAATTCCGGTGTCGTTTATTTAGACTTa  <  1:1786750/64‑1 (MQ=255) cAGGTTGTCTGATCCTGAATTACTTGGGCAGTACTTTAATTCCGGTGTCGTTTATTTAGACTTa  <  1:1782056/64‑1 (MQ=255) cAGGTTGTCTGATCCTGAATTACTTGGGCAGTACTTTAATTCCGGTGTCGTTTATTTAGACTTa  <  1:1623452/64‑1 (MQ=255) cAGGTTGTCTGATCCTGAATTACTTGGGCAGTACTTTAATTCCGGTGTCGTTTATTTAGACTTa  <  1:1500489/64‑1 (MQ=255) cAGGTTGTCTGATCCTGAATTACTTGGGCAGTACTTTAATTCCGGTGTCGTTTATTTAGACTTa  <  1:1497985/64‑1 (MQ=255) cAGGTTGTCTGATCCTGAATTACTTGGGCAGTACTTTAATTCCGGTGTCGTTTATTTAGACTTa  <  1:1468294/64‑1 (MQ=255)  aGGTTGTCTGATCCTGAATTACTTGGGCAGTACTTTAATTCCGGTGTCGTTTATTTAGACTTa  <  1:635589/63‑1 (MQ=255)      tGTCTGATCCTGAATTACTTGGGCAGTACTTTAATTCCGGTGTCGTTTATTTAGACTTa  <  1:1294688/59‑1 (MQ=255)        tCTGATCCTGAATTACTTGGGCAGTACTTTAATTCCGGTGTCGTTTATTTAGACTTa  <  1:1473399/57‑1 (MQ=255)          tGATCCTGAATTACTTGGGCAGTACTTTAATTCCGGTGTCGTTTATTTAGACTTa  <  1:1025116/55‑1 (MQ=255)            aTCCTGAATTACTTGGGCAGTACTTTAATTCCGGTGTCGTTTATTTAGACTTa  <  1:572227/53‑1 (MQ=255)                                                                | CAGGTTGTCTGATCCTGAATTACTTGGGCAGTACTTTAATTCCGGTGTCGTTTATTTAGACTTA  >  W3110S.gb/3838918‑3838981

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑