Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 3839169 3839660 492 163 [0] [0] 3 [rfaJ]–[rfaY] [rfaJ],[rfaY]

Only 100 of 163 total aligned reads displayed.

TTGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCAAA  >  W3110S.gb/3839105‑3839168
                                                               |
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAATGAGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:1473922/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAATGACAAAACACATCaaa  >  1:896238/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:445994/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:621050/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:607403/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:60405/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:598036/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:57983/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:545294/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:542562/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:524087/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:499392/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:475200/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:462344/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:652284/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:406261/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:386687/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:381873/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:360250/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:322366/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:313160/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:268086/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:260090/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:225519/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:209994/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:200581/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:854996/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:986581/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:972054/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:97020/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:957192/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:952510/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:945960/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:926567/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:919607/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:918603/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:890457/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:863342/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:188755/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:851701/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:836842/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:82435/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:823580/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:804340/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:801016/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:7652/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:720034/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:691823/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:668456/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:658444/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:1269797/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:1005406/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:1416372/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:1408323/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:1399886/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:1394574/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:137278/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:1358415/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:1339140/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:133713/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:1330790/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:1319953/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:1277748/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:1427418/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:1264019/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:1263022/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:1253739/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:1247219/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:1193112/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:1134881/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:1111462/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:1092543/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:1071108/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:1045799/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:1006903/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:1665963/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:1853647/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:1851550/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:1839803/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:1827519/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:182222/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:1776382/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:177098/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:1747107/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:1726123/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:1725524/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:1716311/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:1700438/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:143062/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:1631054/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:1627859/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:1625411/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:1617986/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:160304/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:1578826/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:1533674/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:1504696/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:148737/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:1456123/1‑64 (MQ=255)
ttGCCTCGAGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCaaa  >  1:746370/1‑64 (MQ=255)
                                                               |
TTGCCTCGTGAGTACAATACAATTTATACAATTAAAAGTGAATTAAAAGACAAAACACATCAAA  >  W3110S.gb/3839105‑3839168

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: