Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 3860655 3860787 133 151 [0] [0] 116 lldR DNA‑binding transcriptional repressor

Only 100 of 151 total aligned reads displayed.

GCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAG  >  W3110S.gb/3860591‑3860654
                                                               |
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCTAg  <  1:243092/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:44714/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:671166/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:648642/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:641819/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:625140/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:611783/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:582665/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:557973/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:539529/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:501660/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:49297/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:46398/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:681580/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:429843/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:402840/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:387968/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:342519/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:311583/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:302744/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:29501/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:256359/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:1004180/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:22170/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:845471/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:980525/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:96490/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:964576/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:932711/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:920905/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:902446/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:898487/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:897205/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:88802/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:883320/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:872982/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:234404/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:843331/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:807473/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:798994/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:790708/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:772408/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:771236/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:741755/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:740121/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:722686/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:704629/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:683207/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:1223839/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:208391/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:1458242/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:1447253/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:1399042/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:1386609/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:1362900/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:1349596/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:1308185/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:1297006/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:1265638/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:1258071/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:1254048/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:1465855/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:1217801/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:1197155/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:1195764/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:1161783/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:1126657/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:1123021/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:1102382/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:1096522/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:1054093/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:1049896/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:1020055/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:1690867/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:200403/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:193634/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:1856970/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:1838148/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:1826154/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:1798516/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:1778781/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:1758173/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:1728241/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:1712875/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:1515318/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:16867/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:1676090/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:1673751/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:1629863/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:1617533/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:1616052/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:1608904/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:160418/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:1520923/64‑1 (MQ=255)
gCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGGGGCGAg  <  1:349504/64‑1 (MQ=255)
gCGTGTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:604736/64‑1 (MQ=255)
 cGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:1665846/63‑1 (MQ=255)
     tttCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:864026/59‑1 (MQ=255)
               gAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:1320186/49‑1 (MQ=255)
                          aTGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAg  <  1:246810/38‑1 (MQ=255)
                                                               |
GCGTTTTTCTCCCTCGAATGCTCATTATGCTCACCGGGCAGGCGGGTAATCCGTGCGTGGCGAG  >  W3110S.gb/3860591‑3860654

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑