Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3872056	3872071	16	41 [0]	[0] 184	yibG	conserved hypothetical protein

TCTTTCCAAGAATCGCAATTGTTTGTAAATGTTATTTTTAGTAAAGCAGTAATATTGATATAGT  >  W3110S.gb/3871992‑3872055                                                                | tCTTTCCAAGAATCGCAATTGTTTGTAAATGTTGTTTTTAGTAAAGCAGTAATATTGATATAGt  >  1:1771770/1‑64 (MQ=255) tCTTTCCAAGAATCGCAATTGTTTGTAAATGTTATTTTTAGTAAAGCAGTAATATTGATATAGt  >  1:447863/1‑64 (MQ=255) tCTTTCCAAGAATCGCAATTGTTTGTAAATGTTATTTTTAGTAAAGCAGTAATATTGATATAGt  >  1:1841237/1‑64 (MQ=255) tCTTTCCAAGAATCGCAATTGTTTGTAAATGTTATTTTTAGTAAAGCAGTAATATTGATATAGt  >  1:1872384/1‑64 (MQ=255) tCTTTCCAAGAATCGCAATTGTTTGTAAATGTTATTTTTAGTAAAGCAGTAATATTGATATAGt  >  1:229593/1‑64 (MQ=255) tCTTTCCAAGAATCGCAATTGTTTGTAAATGTTATTTTTAGTAAAGCAGTAATATTGATATAGt  >  1:253531/1‑64 (MQ=255) tCTTTCCAAGAATCGCAATTGTTTGTAAATGTTATTTTTAGTAAAGCAGTAATATTGATATAGt  >  1:261979/1‑64 (MQ=255) tCTTTCCAAGAATCGCAATTGTTTGTAAATGTTATTTTTAGTAAAGCAGTAATATTGATATAGt  >  1:330099/1‑64 (MQ=255) tCTTTCCAAGAATCGCAATTGTTTGTAAATGTTATTTTTAGTAAAGCAGTAATATTGATATAGt  >  1:3380/1‑64 (MQ=255) tCTTTCCAAGAATCGCAATTGTTTGTAAATGTTATTTTTAGTAAAGCAGTAATATTGATATAGt  >  1:400764/1‑64 (MQ=255) tCTTTCCAAGAATCGCAATTGTTTGTAAATGTTATTTTTAGTAAAGCAGTAATATTGATATAGt  >  1:420971/1‑64 (MQ=255) tCTTTCCAAGAATCGCAATTGTTTGTAAATGTTATTTTTAGTAAAGCAGTAATATTGATATAGt  >  1:946636/1‑64 (MQ=255) tCTTTCCAAGAATCGCAATTGTTTGTAAATGTTATTTTTAGTAAAGCAGTAATATTGATATAGt  >  1:504543/1‑64 (MQ=255) tCTTTCCAAGAATCGCAATTGTTTGTAAATGTTATTTTTAGTAAAGCAGTAATATTGATATAGt  >  1:609248/1‑64 (MQ=255) tCTTTCCAAGAATCGCAATTGTTTGTAAATGTTATTTTTAGTAAAGCAGTAATATTGATATAGt  >  1:674612/1‑64 (MQ=255) tCTTTCCAAGAATCGCAATTGTTTGTAAATGTTATTTTTAGTAAAGCAGTAATATTGATATAGt  >  1:716699/1‑64 (MQ=255) tCTTTCCAAGAATCGCAATTGTTTGTAAATGTTATTTTTAGTAAAGCAGTAATATTGATATAGt  >  1:735799/1‑64 (MQ=255) tCTTTCCAAGAATCGCAATTGTTTGTAAATGTTATTTTTAGTAAAGCAGTAATATTGATATAGt  >  1:79014/1‑64 (MQ=255) tCTTTCCAAGAATCGCAATTGTTTGTAAATGTTATTTTTAGTAAAGCAGTAATATTGATATAGt  >  1:805072/1‑64 (MQ=255) tCTTTCCAAGAATCGCAATTGTTTGTAAATGTTATTTTTAGTAAAGCAGTAATATTGATATAGt  >  1:815152/1‑64 (MQ=255) tCTTTCCAAGAATCGCAATTGTTTGTAAATGTTATTTTTAGTAAAGCAGTAATATTGATATAGt  >  1:1086999/1‑64 (MQ=255) tCTTTCCAAGAATCGCAATTGTTTGTAAATGTTATTTTTAGTAAAGCAGTAATATTGATATAGt  >  1:1389866/1‑64 (MQ=255) tCTTTCCAAGAATCGCAATTGTTTGTAAATGTTATTTTTAGTAAAGCAGTAATATTGATATAGt  >  1:1111184/1‑64 (MQ=255) tCTTTCCAAGAATCGCAATTGTTTGTAAATGTTATTTTTAGTAAAGCAGTAATATTGATATAGt  >  1:1131920/1‑64 (MQ=255) tCTTTCCAAGAATCGCAATTGTTTGTAAATGTTATTTTTAGTAAAGCAGTAATATTGATATAGt  >  1:1147393/1‑64 (MQ=255) tCTTTCCAAGAATCGCAATTGTTTGTAAATGTTATTTTTAGTAAAGCAGTAATATTGATATAGt  >  1:1152840/1‑64 (MQ=255) tCTTTCCAAGAATCGCAATTGTTTGTAAATGTTATTTTTAGTAAAGCAGTAATATTGATATAGt  >  1:1206946/1‑64 (MQ=255) tCTTTCCAAGAATCGCAATTGTTTGTAAATGTTATTTTTAGTAAAGCAGTAATATTGATATAGt  >  1:1244532/1‑64 (MQ=255) tCTTTCCAAGAATCGCAATTGTTTGTAAATGTTATTTTTAGTAAAGCAGTAATATTGATATAGt  >  1:1263028/1‑64 (MQ=255) tCTTTCCAAGAATCGCAATTGTTTGTAAATGTTATTTTTAGTAAAGCAGTAATATTGATATAGt  >  1:1281701/1‑64 (MQ=255) tCTTTCCAAGAATCGCAATTGTTTGTAAATGTTATTTTTAGTAAAGCAGTAATATTGATATAGt  >  1:1382668/1‑64 (MQ=255) tCTTTCCAAGAATCGCAATTGTTTGTAAATGTTATTTTTAGTAAAGCAGTAATATTGATATAGt  >  1:1839241/1‑64 (MQ=255) tCTTTCCAAGAATCGCAATTGTTTGTAAATGTTATTTTTAGTAAAGCAGTAATATTGATATAGt  >  1:1404788/1‑64 (MQ=255) tCTTTCCAAGAATCGCAATTGTTTGTAAATGTTATTTTTAGTAAAGCAGTAATATTGATATAGt  >  1:1456642/1‑64 (MQ=255) tCTTTCCAAGAATCGCAATTGTTTGTAAATGTTATTTTTAGTAAAGCAGTAATATTGATATAGt  >  1:1497808/1‑64 (MQ=255) tCTTTCCAAGAATCGCAATTGTTTGTAAATGTTATTTTTAGTAAAGCAGTAATATTGATATAGt  >  1:1498127/1‑64 (MQ=255) tCTTTCCAAGAATCGCAATTGTTTGTAAATGTTATTTTTAGTAAAGCAGTAATATTGATATAGt  >  1:1510094/1‑64 (MQ=255) tCTTTCCAAGAATCGCAATTGTTTGTAAATGTTATTTTTAGTAAAGCAGTAATATTGATATAGt  >  1:1546290/1‑64 (MQ=255) tCTTTCCAAGAATCGCAATTGTTTGTAAATGTTATTTTTAGTAAAGCAGTAATATTGATATAGt  >  1:1579350/1‑64 (MQ=255) tCTTTCCAAGAATCGCAATTGTTTGTAAATGTTATTTTTAGTAAAGCAGTAATATTGATATAGt  >  1:1724768/1‑64 (MQ=255) tCTTTCCAAGAATCGCAATTGTTTGTAAATGTTATTTTTAGTAAAGCAGTAATATTGATATAGt  >  1:1744774/1‑64 (MQ=255)                                                                | TCTTTCCAAGAATCGCAATTGTTTGTAAATGTTATTTTTAGTAAAGCAGTAATATTGATATAGT  >  W3110S.gb/3871992‑3872055

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑