Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3896288	3896316	29	14 [0]	[0] 79	yiaL	conserved hypothetical protein

AATGCGACTTTAACCACAATTTTTCGTATCTCAGAGGCTGTTTGCATAATACAACCTGGTCGGTG  >  W3110S.gb/3896223‑3896287                                                                 | aaTGCGACTTTAACCACAATTTTTCGTATCTCATAGGCTGTTTGCATAATACAACCTGGTCGGTg  <  1:560035/65‑1 (MQ=255) aaTGCGACTTTAACCACAATTTTTCGTATCTCAGAGGCTGTTTGCATAATACAACCTGGTCGGTg  <  1:1075973/65‑1 (MQ=255) aaTGCGACTTTAACCACAATTTTTCGTATCTCAGAGGCTGTTTGCATAATACAACCTGGTCGGTg  <  1:1217388/65‑1 (MQ=255) aaTGCGACTTTAACCACAATTTTTCGTATCTCAGAGGCTGTTTGCATAATACAACCTGGTCGGTg  <  1:1265253/65‑1 (MQ=255) aaTGCGACTTTAACCACAATTTTTCGTATCTCAGAGGCTGTTTGCATAATACAACCTGGTCGGTg  <  1:1578454/65‑1 (MQ=255) aaTGCGACTTTAACCACAATTTTTCGTATCTCAGAGGCTGTTTGCATAATACAACCTGGTCGGTg  <  1:1796485/65‑1 (MQ=255) aaTGCGACTTTAACCACAATTTTTCGTATCTCAGAGGCTGTTTGCATAATACAACCTGGTCGGTg  <  1:1801056/65‑1 (MQ=255) aaTGCGACTTTAACCACAATTTTTCGTATCTCAGAGGCTGTTTGCATAATACAACCTGGTCGGTg  <  1:295141/65‑1 (MQ=255) aaTGCGACTTTAACCACAATTTTTCGTATCTCAGAGGCTGTTTGCATAATACAACCTGGTCGGTg  <  1:649560/65‑1 (MQ=255) aaTGCGACTTTAACCACAATTTTTCGTATCTCAGAGGCTGTTTGCATAATACAACCTGGTCGGTg  <  1:65196/65‑1 (MQ=255) aaTGCGACTTTAACCACAATTTTTCGTATCTCAGAGGCTGTTTGCATAATACAACCTGGTCGGTg  <  1:68984/65‑1 (MQ=255) aaTGCGACTTTAACCACAATTTTTCGTATCTCAGAGGCTGTTTGCATAATACAACCTGGTCGGTg  <  1:736789/65‑1 (MQ=255) aaTGCGACTTTAACCACAATTTTTCGTATCTCAGAGGCTGTTTGCATAATACAACCTGGTCGGTg  <  1:754516/65‑1 (MQ=255) aaTGCGACTTTAACCACAATTTTTCGTATCTCAGAGGCTGTTTGCATAATACAACCTGGGCGGTg  <  1:657353/65‑1 (MQ=255)                                                                 | AATGCGACTTTAACCACAATTTTTCGTATCTCAGAGGCTGTTTGCATAATACAACCTGGTCGGTG  >  W3110S.gb/3896223‑3896287

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑