Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3897841	3898006	166	46 [0]	[0] 2	[yiaJ]	[yiaJ]

GGCAATCTGATTGATGAATTTCAAAAGACATAAAAATCAATTGGTTATAAATTATCTGTCGAGAT  >  W3110S.gb/3897776‑3897840                                                                 | ggCAATCTGATTGATGAATTTCAAAAGACATAAAAATCAATTGGTTATAAATTATCTGTCGAGAt  <  1:569872/65‑1 (MQ=255) ggCAATCTGATTGATGAATTTCAAAAGACATAAAAATCAATTGGTTATAAATTATCTGTCGAGAt  <  1:168487/65‑1 (MQ=255) ggCAATCTGATTGATGAATTTCAAAAGACATAAAAATCAATTGGTTATAAATTATCTGTCGAGAt  <  1:1739829/65‑1 (MQ=255) ggCAATCTGATTGATGAATTTCAAAAGACATAAAAATCAATTGGTTATAAATTATCTGTCGAGAt  <  1:1002724/65‑1 (MQ=255) ggCAATCTGATTGATGAATTTCAAAAGACATAAAAATCAATTGGTTATAAATTATCTGTCGAGAt  <  1:209144/65‑1 (MQ=255) ggCAATCTGATTGATGAATTTCAAAAGACATAAAAATCAATTGGTTATAAATTATCTGTCGAGAt  <  1:288112/65‑1 (MQ=255) ggCAATCTGATTGATGAATTTCAAAAGACATAAAAATCAATTGGTTATAAATTATCTGTCGAGAt  <  1:305583/65‑1 (MQ=255) ggCAATCTGATTGATGAATTTCAAAAGACATAAAAATCAATTGGTTATAAATTATCTGTCGAGAt  <  1:335089/65‑1 (MQ=255) ggCAATCTGATTGATGAATTTCAAAAGACATAAAAATCAATTGGTTATAAATTATCTGTCGAGAt  <  1:459774/65‑1 (MQ=255) ggCAATCTGATTGATGAATTTCAAAAGACATAAAAATCAATTGGTTATAAATTATCTGTCGAGAt  <  1:1792630/65‑1 (MQ=255) ggCAATCTGATTGATGAATTTCAAAAGACATAAAAATCAATTGGTTATAAATTATCTGTCGAGAt  <  1:626866/65‑1 (MQ=255) ggCAATCTGATTGATGAATTTCAAAAGACATAAAAATCAATTGGTTATAAATTATCTGTCGAGAt  <  1:682138/65‑1 (MQ=255) ggCAATCTGATTGATGAATTTCAAAAGACATAAAAATCAATTGGTTATAAATTATCTGTCGAGAt  <  1:736849/65‑1 (MQ=255) ggCAATCTGATTGATGAATTTCAAAAGACATAAAAATCAATTGGTTATAAATTATCTGTCGAGAt  <  1:880225/65‑1 (MQ=255) ggCAATCTGATTGATGAATTTCAAAAGACATAAAAATCAATTGGTTATAAATTATCTGTCGAGAt  <  1:904329/65‑1 (MQ=255) ggCAATCTGATTGATGAATTTCAAAAGACATAAAAATCAATTGGTTATAAATTATCTGTCGAGAt  <  1:904784/65‑1 (MQ=255) ggCAATCTGATTGATGAATTTCAAAAGACATAAAAATCAATTGGTTATAAATTATCTGTCGAGAt  <  1:915403/65‑1 (MQ=255) ggCAATCTGATTGATGAATTTCAAAAGACATAAAAATCAATTGGTTATAAATTATCTGTCGAGAt  <  1:991267/65‑1 (MQ=255) ggCAATCTGATTGATGAATTTCAAAAGACATAAAAATCAATTGGTTATAAATTATCTGTCGAGAt  <  1:1615358/65‑1 (MQ=255) ggCAATCTGATTGATGAATTTCAAAAGACATAAAAATCAATTGGTTATAAATTATCTGTCGAGAt  <  1:1018054/65‑1 (MQ=255) ggCAATCTGATTGATGAATTTCAAAAGACATAAAAATCAATTGGTTATAAATTATCTGTCGAGAt  <  1:1033204/65‑1 (MQ=255) ggCAATCTGATTGATGAATTTCAAAAGACATAAAAATCAATTGGTTATAAATTATCTGTCGAGAt  <  1:1058766/65‑1 (MQ=255) ggCAATCTGATTGATGAATTTCAAAAGACATAAAAATCAATTGGTTATAAATTATCTGTCGAGAt  <  1:1114548/65‑1 (MQ=255) ggCAATCTGATTGATGAATTTCAAAAGACATAAAAATCAATTGGTTATAAATTATCTGTCGAGAt  <  1:1186577/65‑1 (MQ=255) ggCAATCTGATTGATGAATTTCAAAAGACATAAAAATCAATTGGTTATAAATTATCTGTCGAGAt  <  1:1193181/65‑1 (MQ=255) ggCAATCTGATTGATGAATTTCAAAAGACATAAAAATCAATTGGTTATAAATTATCTGTCGAGAt  <  1:121044/65‑1 (MQ=255) ggCAATCTGATTGATGAATTTCAAAAGACATAAAAATCAATTGGTTATAAATTATCTGTCGAGAt  <  1:1289330/65‑1 (MQ=255) ggCAATCTGATTGATGAATTTCAAAAGACATAAAAATCAATTGGTTATAAATTATCTGTCGAGAt  <  1:1346455/65‑1 (MQ=255) ggCAATCTGATTGATGAATTTCAAAAGACATAAAAATCAATTGGTTATAAATTATCTGTCGAGAt  <  1:1659195/65‑1 (MQ=255) ggCAATCTGATTGATGAATTTCAAAAGACATAAAAATCAATTGGTTATAAATTATCTGTCGAGAt  <  1:1455132/65‑1 (MQ=255)  gCAATCTGATTGATGAATTTCAAAAGACATAAAAATCAATTGGTTATAAATTATCTGTCGAGAt  <  1:1306416/64‑1 (MQ=255)  gCAATCTGATTGATGAATTTCAAAAGACATAAAAATCAATTGGTTATAAATTATCTGTCGAGAt  <  1:1730851/64‑1 (MQ=255)  gCAATCTGATTGATGAATTTCAAAAGACATAAAAATCAATTGGTTATAAATTATCTGTCGAGAt  <  1:1738681/64‑1 (MQ=255)  gCAATCTGATTGATGAATTTCAAAAGACATAAAAATCAATTGGTTATAAATTATCTGTCGAGAt  <  1:1824713/64‑1 (MQ=255)  gCAATCTGATTGATGAATTTCAAAAGACATAAAAATCAATTGGTTATAAATTATCTGTCGAGAt  <  1:1410574/64‑1 (MQ=255)  gCAATCTGATTGATGAATTTCAAAAGACATAAAAATCAATTGGTTATAAATTATCTGTCGAGAt  <  1:1280863/64‑1 (MQ=255)  gCAATCTGATTGATGAATTTCAAAAGACATAAAAATCAATTGGTTATAAATTATCTGTCGAGAt  <  1:376852/64‑1 (MQ=255)  gCAATCTGATTGATGAATTTCAAAAGACATAAAAATCAATTGGTTATAAATTATCTGTCGAGAt  <  1:344247/64‑1 (MQ=255)  gCAATCTGATTGATGAATTTCAAAAGACATAAAAATCAATTGGTTATAAATTATCTGTCGAGAt  <  1:330461/64‑1 (MQ=255)  gCAATCTGATTGATGAATTTCAAAAGACATAAAAATCAATTGGTTATAAATTATCTGTCGAGAt  <  1:306907/64‑1 (MQ=255)  gCAATCTGATTGATGAATTTCAAAAGACATAAAAATCAATTGGTTATAAATTATCTGTCGAGAt  <  1:234298/64‑1 (MQ=255)   cAATCTGATTGATGAATTTCAAAAGACATAAAAATCAATTGGTTATAAATTATCTGTCGAGAt  <  1:214229/63‑1 (MQ=255)    aaTCTGATTGATGAATTTCAAAAGACATAAAAATCAATTGGTTATAAATTATCTGTCGAGAt  <  1:1301182/62‑1 (MQ=255)              atgaATTTCAAAAGACATAAAAATCAATTGGTTATAAATTATCTGTCGAGAt  <  1:1252451/52‑1 (MQ=255)                 aaTTTCAAAAGACATAAAAATCAATTGGTTATAAATTATCTGTCGAGAt  <  1:943767/49‑1 (MQ=255)                   tttCAAAAGACATAAAAATCAATTGGTTATAAATTATCTGTCGAGAt  <  1:150175/47‑1 (MQ=255)                                                                 | GGCAATCTGATTGATGAATTTCAAAAGACATAAAAATCAATTGGTTATAAATTATCTGTCGAGAT  >  W3110S.gb/3897776‑3897840

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑