Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3943828	3943866	39	10 [0]	[0] 10	bcsE	conserved hypothetical protein

CCGGATCGCTGTCCATGCTAATGACCGCGACGTGTGCGGTTTCAGCCTGGGATGCAATTGTTTG  >  W3110S.gb/3943764‑3943827                                                                | ccGGATCGCTGTCCATGCTAATGACCGCGACGTGTGCGGTTTCAGCCTGGGATGCAATTGTTTg  <  1:1209339/64‑1 (MQ=255) ccGGATCGCTGTCCATGCTAATGACCGCGACGTGTGCGGTTTCAGCCTGGGATGCAATTGTTTg  <  1:1285943/64‑1 (MQ=255) ccGGATCGCTGTCCATGCTAATGACCGCGACGTGTGCGGTTTCAGCCTGGGATGCAATTGTTTg  <  1:135140/64‑1 (MQ=255) ccGGATCGCTGTCCATGCTAATGACCGCGACGTGTGCGGTTTCAGCCTGGGATGCAATTGTTTg  <  1:1441807/64‑1 (MQ=255) ccGGATCGCTGTCCATGCTAATGACCGCGACGTGTGCGGTTTCAGCCTGGGATGCAATTGTTTg  <  1:1685756/64‑1 (MQ=255) ccGGATCGCTGTCCATGCTAATGACCGCGACGTGTGCGGTTTCAGCCTGGGATGCAATTGTTTg  <  1:1687857/64‑1 (MQ=255) ccGGATCGCTGTCCATGCTAATGACCGCGACGTGTGCGGTTTCAGCCTGGGATGCAATTGTTTg  <  1:550514/64‑1 (MQ=255) ccGGATCGCTGTCCATGCTAATGACCGCGACGTGTGCGGTTTCAGCCTGGGATGCAATTGTTTg  <  1:605500/64‑1 (MQ=255) ccGGATCGCTGTCCATGCTAATGACCGCGACGTGTGCGGTTTCAGCCTGGGATGCAATTGTTTg  <  1:984056/64‑1 (MQ=255) ccGGATCGCTGTCCATGCTAATGACCGCGACGTGTGCGGTTTCAGCCTGGGATGCAATTGTTTg  <  1:991467/64‑1 (MQ=255)                                                                | CCGGATCGCTGTCCATGCTAATGACCGCGACGTGTGCGGTTTCAGCCTGGGATGCAATTGTTTG  >  W3110S.gb/3943764‑3943827

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑