Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3976074	3976292	219	84 [0]	[1] 62	gadW	DNA‑binding transcriptional activator

AATTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAC  >  W3110S.gb/3976009‑3976073                                                                 | aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGCCCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:1315955/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCCCCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:636084/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGGTGGTGAc  >  1:363523/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:2815/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:546910/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:431854/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:409675/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:398603/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:396581/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:339736/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:305710/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:555210/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:280723/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:259647/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:250092/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:226247/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:225900/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:219385/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:218834/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:210869/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:1802997/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:1008796/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:894908/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:998763/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:973659/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:972355/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:939781/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:936694/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:932641/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:919134/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:911280/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:902316/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:547119/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:893283/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:890670/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:85229/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:742510/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:642248/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:624053/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:617739/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:559251/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:1795449/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:1175580/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:1359101/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:1768173/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:1297180/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:1290135/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:1277575/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:1275600/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:1249829/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:1203506/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:1197780/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:1332785/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:1136833/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:1128845/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:1108212/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:103221/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:1026623/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:101834/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:101782/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:1015444/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:1009703/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:1371194/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:1765412/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:175803/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:1746752/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:1722621/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:167401/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:165750/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:1595447/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:1574085/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:1566238/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:1553250/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:1519754/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:1514520/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:1426099/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:1413339/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:1409596/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:140651/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:1378585/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:1360094/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGACGCTGGTGAc  >  1:1179310/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCACCATGCCGCTGGTGAc  >  1:590315/1‑65 (MQ=255) aaTTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAACTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAc  >  1:845531/1‑65 (MQ=255)                                                                 | AATTTAGGGTTACACAGCAAAGACCGTTTGTTAATTAACCAGTCACCCCCCATGCCGCTGGTGAC  >  W3110S.gb/3976009‑3976073

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑