Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 3978427 3978553 127 175 [0] [0] 60 mdtF multidrug transporter, RpoS‑dependent

Only 100 of 175 total aligned reads displayed.

CGCAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCG  >  W3110S.gb/3978362‑3978426
                                                                |
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:213482/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:478202/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:460003/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:404847/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:403498/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:393420/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:375004/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:333107/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:288560/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:248962/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:241351/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:217044/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:49994/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:213140/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1869293/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1850173/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1831713/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1826972/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1788477/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1760770/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1745495/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1741647/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1713569/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:743498/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:978526/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:958674/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:930555/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:917584/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:81878/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:790539/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:779550/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:762816/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:758804/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:749039/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1762974/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:726105/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:724238/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:689713/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:674707/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:665540/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:636314/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:606876/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:590299/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:570321/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:535753/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1164194/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1429558/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1421709/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:138113/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1349442/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:127571/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:127271/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1259573/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:119293/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1188357/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1173901/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1656527/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1152515/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1144737/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1128667/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1120816/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1103935/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1086279/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:107611/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1063527/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1049878/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1035122/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1438297/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1566756/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1549897/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1543995/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1572483/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1619179/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1518797/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1630827/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1500876/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1632048/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1453252/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1642795/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1687581/65‑1 (MQ=255)
cgcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1442015/65‑1 (MQ=255)
 gcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1016679/64‑1 (MQ=255)
 gcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1073029/64‑1 (MQ=255)
 gcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:158358/64‑1 (MQ=255)
 gcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1024466/64‑1 (MQ=255)
 gcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1524254/64‑1 (MQ=255)
 gcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:656067/64‑1 (MQ=255)
 gcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1207265/64‑1 (MQ=255)
 gcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:246019/64‑1 (MQ=255)
 gcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1299079/64‑1 (MQ=255)
 gcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1378203/64‑1 (MQ=255)
 gcAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:348395/64‑1 (MQ=255)
   aaaTCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1649253/62‑1 (MQ=255)
             gTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:659711/52‑1 (MQ=255)
                   caccaTGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:771959/46‑1 (MQ=255)
                        tGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:437771/41‑1 (MQ=255)
                          tAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:1089921/39‑1 (MQ=255)
                           aGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:75902/38‑1 (MQ=255)
                            gCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:268217/37‑1 (MQ=255)
                              gACCTGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCg  <  1:854652/35‑1 (MQ=255)
                                                                |
CGCAAATCAGCAGGTAGACCACCATGTAGCGACCGGTACAACGCAACAGCGAGCGGGTGCTATCG  >  W3110S.gb/3978362‑3978426

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: