Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	3982297	3982449	153	22 [0]	[0] 147	gadE/hdeD	DNA‑binding transcriptional activator/acid‑resistance membrane protein

CTAAGTAAGATTCCTGGTTGTTATCAGCTTGTAAATAGCAAACAAAAAGTTAACGTTTGCGGATT  >  W3110S.gb/3982232‑3982296                                                                 | cTAAGTAAGATTCCTGGTTGTTATCAGCTTGTAAATAGCAAACAAAAAGTTAACGTTTGCGGAtt  >  1:1799223/1‑65 (MQ=255) cTAAGTAAGATTCCTGGTTGTTATCAGCTTGTAAATAGCAAACAAAAAGTTAACGTTTGCGGAtt  >  1:818262/1‑65 (MQ=255) cTAAGTAAGATTCCTGGTTGTTATCAGCTTGTAAATAGCAAACAAAAAGTTAACGTTTGCGGAtt  >  1:802572/1‑65 (MQ=255) cTAAGTAAGATTCCTGGTTGTTATCAGCTTGTAAATAGCAAACAAAAAGTTAACGTTTGCGGAtt  >  1:793734/1‑65 (MQ=255) cTAAGTAAGATTCCTGGTTGTTATCAGCTTGTAAATAGCAAACAAAAAGTTAACGTTTGCGGAtt  >  1:700380/1‑65 (MQ=255) cTAAGTAAGATTCCTGGTTGTTATCAGCTTGTAAATAGCAAACAAAAAGTTAACGTTTGCGGAtt  >  1:675084/1‑65 (MQ=255) cTAAGTAAGATTCCTGGTTGTTATCAGCTTGTAAATAGCAAACAAAAAGTTAACGTTTGCGGAtt  >  1:623357/1‑65 (MQ=255) cTAAGTAAGATTCCTGGTTGTTATCAGCTTGTAAATAGCAAACAAAAAGTTAACGTTTGCGGAtt  >  1:612913/1‑65 (MQ=255) cTAAGTAAGATTCCTGGTTGTTATCAGCTTGTAAATAGCAAACAAAAAGTTAACGTTTGCGGAtt  >  1:468770/1‑65 (MQ=255) cTAAGTAAGATTCCTGGTTGTTATCAGCTTGTAAATAGCAAACAAAAAGTTAACGTTTGCGGAtt  >  1:420662/1‑65 (MQ=255) cTAAGTAAGATTCCTGGTTGTTATCAGCTTGTAAATAGCAAACAAAAAGTTAACGTTTGCGGAtt  >  1:224070/1‑65 (MQ=255) cTAAGTAAGATTCCTGGTTGTTATCAGCTTGTAAATAGCAAACAAAAAGTTAACGTTTGCGGAtt  >  1:1007262/1‑65 (MQ=255) cTAAGTAAGATTCCTGGTTGTTATCAGCTTGTAAATAGCAAACAAAAAGTTAACGTTTGCGGAtt  >  1:1457193/1‑65 (MQ=255) cTAAGTAAGATTCCTGGTTGTTATCAGCTTGTAAATAGCAAACAAAAAGTTAACGTTTGCGGAtt  >  1:1455036/1‑65 (MQ=255) cTAAGTAAGATTCCTGGTTGTTATCAGCTTGTAAATAGCAAACAAAAAGTTAACGTTTGCGGAtt  >  1:144004/1‑65 (MQ=255) cTAAGTAAGATTCCTGGTTGTTATCAGCTTGTAAATAGCAAACAAAAAGTTAACGTTTGCGGAtt  >  1:1407985/1‑65 (MQ=255) cTAAGTAAGATTCCTGGTTGTTATCAGCTTGTAAATAGCAAACAAAAAGTTAACGTTTGCGGAtt  >  1:1332398/1‑65 (MQ=255) cTAAGTAAGATTCCTGGTTGTTATCAGCTTGTAAATAGCAAACAAAAAGTTAACGTTTGCGGAtt  >  1:1300044/1‑65 (MQ=255) cTAAGTAAGATTCCTGGTTGTTATCAGCTTGTAAATAGCAAACAAAAAGTTAACGTTTGCGGAtt  >  1:1218302/1‑65 (MQ=255) cTAAGTAAGATTCCTGGTTGTTATCAGCTTGTAAATAGCAAACAAAAAGTTAACGTTTGCGGAtt  >  1:1124425/1‑65 (MQ=255) cTAAGTAAGATTCCTGGTTGTTATCAGCTTGTAAATAGCAAACAAAAAGTTAACGTTTGCGGAtt  >  1:1069962/1‑65 (MQ=255) cTAAGTAAGATTCCTGGTTGTTATCAGCTTGTAAATAGCAAACAAAAAGTTAACGTTTGCGGAtt  >  1:1041616/1‑65 (MQ=255)                                                                 | CTAAGTAAGATTCCTGGTTGTTATCAGCTTGTAAATAGCAAACAAAAAGTTAACGTTTGCGGATT  >  W3110S.gb/3982232‑3982296

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑