Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3986397	3986481	85	53 [0]	[0] 51	[slp]	[slp]

GAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGA  >  W3110S.gb/3986333‑3986396                                                                | gAACATCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:1190015/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTTAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:1172837/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:685252/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:1760296/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:221253/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:232710/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:257482/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:28146/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:282388/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:31106/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:362360/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:422469/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:494543/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:513760/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:645061/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:677211/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:1610405/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:695816/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:697359/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:711626/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:719683/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:807530/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:84581/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:858682/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:894783/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:93104/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:95888/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:971210/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:1409687/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:1012502/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:1024021/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:110954/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:1141332/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:1195447/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:1197529/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:1204040/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:1271166/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:1347991/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:1348432/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:1383764/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:1659153/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:1442085/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:1443232/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:1449541/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:1461168/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:1472211/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:1474284/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:1530135/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:1542305/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:155869/64‑1 (MQ=255) gAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:1563147/64‑1 (MQ=255)  aaCAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:1292877/63‑1 (MQ=255)                  ttttGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGa  <  1:1000274/47‑1 (MQ=255)                                                                | GAACAGCAACAAAACTTTTTTGAATATCAGGTTGGTTATTGCCTTTGATATTTTGCGGAATTGA  >  W3110S.gb/3986333‑3986396

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑