Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4007771	4007838	68	100 [0]	[0] 53	[yhiJ]	[yhiJ]

ATGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATG  >  W3110S.gb/4007707‑4007770                                                                | atGCTTTGAGTCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:1330416/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:34412/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:528758/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:525087/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:502754/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:472756/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:471305/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:461276/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:450493/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:411601/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:388278/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:373198/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:532529/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:339157/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:330416/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:287182/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:253562/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:252458/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:233461/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:223630/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:1877584/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:1830139/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:1828027/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:1795435/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:774412/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:993112/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:903208/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:86742/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:866015/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:849855/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:848946/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:824117/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:805359/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:80045/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:799343/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:774786/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:1801326/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:743473/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:727287/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:685147/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:661983/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:61306/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:594320/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:58342/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:575274/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:574044/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:560081/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:554962/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:1159533/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:1283574/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:127838/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:1264811/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:1252671/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:123494/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:1214248/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:1209557/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:1201822/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:1186033/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:1176409/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:1174959/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:1766539/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:1159094/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:114010/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:1138256/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:1125917/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:1111799/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:1106682/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:1098458/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:1093373/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:1086070/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:1055593/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:1043052/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:1601548/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:1743693/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:1704384/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:1696250/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:1688721/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:1678638/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:1753282/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:1625615/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:1767162/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:1617999/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:1314692/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:158800/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:1580644/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:1537294/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:1536830/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:1469451/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:1443819/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:1394058/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:1376512/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:134409/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:1341493/64‑1 (MQ=255) atGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAACTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:853884/64‑1 (MQ=255)  tGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:1039780/63‑1 (MQ=255)  tGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:79687/63‑1 (MQ=255)              gAATGATTTGAGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGGGTATg  <  1:117340/51‑1 (MQ=255)                aTGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:1010392/49‑1 (MQ=255)                   aTTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:219958/46‑1 (MQ=255)                             aaTATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATg  <  1:265557/36‑1 (MQ=255)                                                                | ATGCTTTGAGGCTGAATGATTTGTGCAAAATATAATTATTTTCCCATCGAACATGAGGTGTATG  >  W3110S.gb/4007707‑4007770

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑