Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4028303	4028387	85	52 [0]	[0] 32	yhhT	predicted inner membrane protein

AAGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATGCCG  >  W3110S.gb/4028238‑4028302                                                                 | aaGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATtccg  <  1:147185/65‑1 (MQ=255) aaGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:105848/65‑1 (MQ=255) aaGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:245897/65‑1 (MQ=255) aaGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:357049/65‑1 (MQ=255) aaGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:361099/65‑1 (MQ=255) aaGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:377567/65‑1 (MQ=255) aaGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:435914/65‑1 (MQ=255) aaGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:474103/65‑1 (MQ=255) aaGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:499655/65‑1 (MQ=255) aaGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:575448/65‑1 (MQ=255) aaGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:581855/65‑1 (MQ=255) aaGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:600194/65‑1 (MQ=255) aaGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:600334/65‑1 (MQ=255) aaGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:618648/65‑1 (MQ=255) aaGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:647426/65‑1 (MQ=255) aaGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:649791/65‑1 (MQ=255) aaGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:665335/65‑1 (MQ=255) aaGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:668717/65‑1 (MQ=255) aaGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:688316/65‑1 (MQ=255) aaGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:690358/65‑1 (MQ=255) aaGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:8109/65‑1 (MQ=255) aaGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:857939/65‑1 (MQ=255) aaGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:952766/65‑1 (MQ=255) aaGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:966081/65‑1 (MQ=255) aaGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:1509539/65‑1 (MQ=255) aaGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:1090610/65‑1 (MQ=255) aaGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:1102222/65‑1 (MQ=255) aaGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:116868/65‑1 (MQ=255) aaGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:1205912/65‑1 (MQ=255) aaGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:1213930/65‑1 (MQ=255) aaGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:1217152/65‑1 (MQ=255) aaGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:1253078/65‑1 (MQ=255) aaGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:1288550/65‑1 (MQ=255) aaGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:1306069/65‑1 (MQ=255) aaGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:1334357/65‑1 (MQ=255) aaGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:1360174/65‑1 (MQ=255) aaGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:1866427/65‑1 (MQ=255) aaGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:152739/65‑1 (MQ=255) aaGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:1649361/65‑1 (MQ=255) aaGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:1693306/65‑1 (MQ=255) aaGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:1695162/65‑1 (MQ=255) aaGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:1700741/65‑1 (MQ=255) aaGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:1737515/65‑1 (MQ=255) aaGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:1775093/65‑1 (MQ=255) aaGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:1777674/65‑1 (MQ=255) aaGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:18228/65‑1 (MQ=255) aaGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:1847145/65‑1 (MQ=255) aaGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCACCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:456551/65‑1 (MQ=255)  aGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:870847/64‑1 (MQ=255)      tGCGCGTCAGCTGCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATTAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:235325/60‑1 (MQ=255)         gcgTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:763815/57‑1 (MQ=255)            tCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATgccg  <  1:485436/54‑1 (MQ=255)                                                                 | AAGTTTGCGCGTCAGCTCCTTATTAAACTTCGGCAGCATAGAGATAAATTCGTTAAACGATGCCG  >  W3110S.gb/4028238‑4028302

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑