Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4039553	4039653	101	25 [0]	[0] 38	[rpoH]	[rpoH]

CGTAATTTATTCACAAGCTTGCATTGAACTTGTGGATAAAATCACGGTCTGATAAAACAGTGAA  >  W3110S.gb/4039489‑4039552                                                                | cGTAATTTATTCACAAGCTTGCATTGAACTTGTGGATAAAATCACGGTCTGATAAAACAGTGaa  <  1:1723163/64‑1 (MQ=255) cGTAATTTATTCACAAGCTTGCATTGAACTTGTGGATAAAATCACGGTCTGATAAAACAGTGaa  <  1:970212/64‑1 (MQ=255) cGTAATTTATTCACAAGCTTGCATTGAACTTGTGGATAAAATCACGGTCTGATAAAACAGTGaa  <  1:813644/64‑1 (MQ=255) cGTAATTTATTCACAAGCTTGCATTGAACTTGTGGATAAAATCACGGTCTGATAAAACAGTGaa  <  1:761507/64‑1 (MQ=255) cGTAATTTATTCACAAGCTTGCATTGAACTTGTGGATAAAATCACGGTCTGATAAAACAGTGaa  <  1:670661/64‑1 (MQ=255) cGTAATTTATTCACAAGCTTGCATTGAACTTGTGGATAAAATCACGGTCTGATAAAACAGTGaa  <  1:63875/64‑1 (MQ=255) cGTAATTTATTCACAAGCTTGCATTGAACTTGTGGATAAAATCACGGTCTGATAAAACAGTGaa  <  1:630290/64‑1 (MQ=255) cGTAATTTATTCACAAGCTTGCATTGAACTTGTGGATAAAATCACGGTCTGATAAAACAGTGaa  <  1:52445/64‑1 (MQ=255) cGTAATTTATTCACAAGCTTGCATTGAACTTGTGGATAAAATCACGGTCTGATAAAACAGTGaa  <  1:512039/64‑1 (MQ=255) cGTAATTTATTCACAAGCTTGCATTGAACTTGTGGATAAAATCACGGTCTGATAAAACAGTGaa  <  1:415711/64‑1 (MQ=255) cGTAATTTATTCACAAGCTTGCATTGAACTTGTGGATAAAATCACGGTCTGATAAAACAGTGaa  <  1:207427/64‑1 (MQ=255) cGTAATTTATTCACAAGCTTGCATTGAACTTGTGGATAAAATCACGGTCTGATAAAACAGTGaa  <  1:1821315/64‑1 (MQ=255) cGTAATTTATTCACAAGCTTGCATTGAACTTGTGGATAAAATCACGGTCTGATAAAACAGTGaa  <  1:1043329/64‑1 (MQ=255) cGTAATTTATTCACAAGCTTGCATTGAACTTGTGGATAAAATCACGGTCTGATAAAACAGTGaa  <  1:1502871/64‑1 (MQ=255) cGTAATTTATTCACAAGCTTGCATTGAACTTGTGGATAAAATCACGGTCTGATAAAACAGTGaa  <  1:1485586/64‑1 (MQ=255) cGTAATTTATTCACAAGCTTGCATTGAACTTGTGGATAAAATCACGGTCTGATAAAACAGTGaa  <  1:1393089/64‑1 (MQ=255) cGTAATTTATTCACAAGCTTGCATTGAACTTGTGGATAAAATCACGGTCTGATAAAACAGTGaa  <  1:138040/64‑1 (MQ=255) cGTAATTTATTCACAAGCTTGCATTGAACTTGTGGATAAAATCACGGTCTGATAAAACAGTGaa  <  1:129091/64‑1 (MQ=255) cGTAATTTATTCACAAGCTTGCATTGAACTTGTGGATAAAATCACGGTCTGATAAAACAGTGaa  <  1:1229797/64‑1 (MQ=255) cGTAATTTATTCACAAGCTTGCATTGAACTTGTGGATAAAATCACGGTCTGATAAAACAGTGaa  <  1:1224891/64‑1 (MQ=255) cGTAATTTATTCACAAGCTTGCATTGAACTTGTGGATAAAATCACGGTCTGATAAAACAGTGaa  <  1:1218014/64‑1 (MQ=255) cGTAATTTATTCACAAGCTTGCATTGAACTTGTGGATAAAATCACGGTCTGATAAAACAGTGaa  <  1:1150251/64‑1 (MQ=255) cGTAATTTATTCACAAGCTTGCATTGAACTTGTGGATAAAATCACGGTCTGATAAAACAGTGaa  <  1:1136056/64‑1 (MQ=255) cGTAATTTATTCACAAGCTTGCATTGAACTTGTGGATAAAATCACGGTCTGATAAAACAGTGaa  <  1:1048291/64‑1 (MQ=255)            cacaAGCTTGCATTGAACTTGTGGATAAAATCACGGTCTGATAAAACAGTGaa  <  1:1822505/53‑1 (MQ=255)                                                                | CGTAATTTATTCACAAGCTTGCATTGAACTTGTGGATAAAATCACGGTCTGATAAAACAGTGAA  >  W3110S.gb/4039489‑4039552

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑