Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 4040151 4040175 25 129 [0] [0] 12 rpoH RNA polymerase, sigma 32 (sigma H) factor

Only 100 of 129 total aligned reads displayed.

GGATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAT  >  W3110S.gb/4040086‑4040150
                                                                |
ggATGAAGTCTAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:1277315/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATTGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:913436/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAATACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:1257263/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGTAt  <  1:240605/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:440218/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:568533/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:567956/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:557042/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:55195/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:511744/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:505192/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:499463/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:497209/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:469918/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:445764/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:635999/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:438819/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:41458/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:382494/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:378470/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:360115/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:357554/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:349679/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:347323/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:329007/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:1015154/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:810800/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:989887/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:98467/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:963601/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:945487/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:904489/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:890341/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:876445/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:86645/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:858533/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:815484/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:815158/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:607298/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:787236/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:779295/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:77075/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:730903/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:728425/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:713937/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:683525/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:652134/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:327680/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:629602/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:120588/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:1385169/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:315270/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:1362621/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:1356066/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:1299413/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:1286908/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:1276243/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:1270425/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:1241585/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:1236690/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:1233870/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:1375320/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:1195717/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:119321/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:1179849/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:117273/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:1153862/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:1138732/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:1123784/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:1082525/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:1082446/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:103626/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:167817/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:186172/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:1841350/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:186567/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:1806488/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:214856/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:1769474/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:1761193/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:1699521/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:1683803/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:257932/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:1515128/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:1484431/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:1450920/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:1450038/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:1440411/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:1416896/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:1394245/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:1389029/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCACCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:1557264/65‑1 (MQ=255)
ggATGAAGTCGAAATGGGGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:275330/65‑1 (MQ=255)
 gATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:922401/64‑1 (MQ=255)
        tCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:936957/57‑1 (MQ=255)
              tggtggCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAATGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:912253/51‑1 (MQ=255)
                   gCCCGTTAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:587599/46‑1 (MQ=255)
                   gCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:801599/46‑1 (MQ=255)
                      cGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:1821200/43‑1 (MQ=255)
                            cTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAt  <  1:1192370/37‑1 (MQ=255)
                                                                |
GGATGAAGTCGAAATGGTGGCCCGTGAACTGGGCGTAACCAGCAAAGACGTACGTGAGATGGAAT  >  W3110S.gb/4040086‑4040150

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑