Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4069564	4069693	130	90 [0]	[0] 107	glgX	glycogen debranching enzyme

CACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAG  >  W3110S.gb/4069500‑4069563                                                                | cACTATGACTGTGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:1540771/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACGATCATTTATGAAg  >  1:293643/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCTTTTATGAAg  >  1:489510/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:1866291/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:427892/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:427891/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:407629/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:40654/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:396385/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:336455/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:33098/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:282917/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:1868430/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:435155/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:185350/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:1818759/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:1818583/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:1787747/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:178588/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:1781149/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:1777169/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:1776284/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:1755329/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:1740742/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:75196/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:996958/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:907898/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:897640/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:885355/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:884974/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:858341/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:819632/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:81953/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:760867/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:752978/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:172666/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:751560/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:711186/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:682365/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:628657/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:624057/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:601053/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:552449/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:53786/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:517376/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:492538/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:1200307/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:1006404/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:1341806/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:1297924/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:129118/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:1289748/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:1289079/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:1272400/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:1236500/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:1223616/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:1218336/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:1345707/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:1191022/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:1184994/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:1176379/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:114691/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:1092025/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:108151/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:1064754/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:1063945/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:1050898/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:1042958/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:1479328/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:1708920/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:170512/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:1675259/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:1642733/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:1633498/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:1599741/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:1567972/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:1560380/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:1541583/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:1386060/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:1467410/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:1466494/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:1442544/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:1439968/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:1434916/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:1426096/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:1415060/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:1411297/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:1400845/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTGATGAAg  >  1:1090236/1‑64 (MQ=255) cACTATGACTGGGAAGATGATGCCCAGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAg  >  1:143375/1‑64 (MQ=255)                                                                | CACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAG  >  W3110S.gb/4069500‑4069563

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑