Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4084487	4084497	11	59 [0]	[0] 86	rtcA	RNA 3'‑terminal phosphate cyclase

TGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCA  >  W3110S.gb/4084423‑4084486                                                                | tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGATTTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:1211023/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTAGGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:813794/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:744199/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:359993/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:3605/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:441811/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:464920/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:487279/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:499197/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:536354/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:556593/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:609570/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:6400/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:657874/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:706285/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:725677/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:1085091/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:766580/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:793787/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:801424/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:867897/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:884354/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:886590/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:907774/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:914119/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:930931/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:970486/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:97889/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:311190/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:107495/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:1099725/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:1100126/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:1242930/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:1290581/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:1306751/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:1321108/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:1421475/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:1432323/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:1553203/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:1555757/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:1604949/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:1609693/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:1661640/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:318289/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:294786/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:277200/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:1884713/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:1878298/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:1870339/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:1839738/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:1796950/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:1726574/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:1676146/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGGCGCCCATCCCTCa  <  1:1131485/64‑1 (MQ=255) tGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGGCGCCCATCCCTCa  <  1:989588/64‑1 (MQ=255)  gACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:888118/63‑1 (MQ=255)  gACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:704153/63‑1 (MQ=255)         tGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:517011/56‑1 (MQ=255)                         gcTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCa  <  1:1204732/40‑1 (MQ=255)                                                                | TGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCA  >  W3110S.gb/4084423‑4084486

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑